76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0883 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0883  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  270  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00210212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3637  hypothetical protein  66.14 
 
 		 133 aa  170  5.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.136644 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0381  hypothetical protein  61.65 
 
 		 153 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2456  hypothetical protein  60.9 
 
 		 136 aa  154  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0408545 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0798  neutral zinc metallopeptidase  60.15 
 
 		 136 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0602  protein of unknown function DUF1025  61.86 
 
 		 133 aa  135  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.911931 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4833  hypothetical protein  54.4 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1420  hypothetical protein  53.6 
 
 		 133 aa  126  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0235  protein of unknown function DUF1025  44.53 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2902  hypothetical protein  48.41 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0499  hypothetical protein  42.19 
 
 		 133 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0343  hypothetical protein  42.97 
 
 		 133 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1187  hypothetical protein  45.74 
 
 		 146 aa  113  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.518231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1389  hypothetical protein  41.54 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1145  protein of unknown function DUF1025  43.51 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108724 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0229  hypothetical protein  40.62 
 
 		 133 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00794732 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3590  hypothetical protein  38.28 
 
 		 133 aa  104  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4376  hypothetical protein  37.21 
 
 		 147 aa  103  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.395833  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3266  hypothetical protein  41.04 
 
 		 154 aa  103  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3893  protein of unknown function DUF1025  37.5 
 
 		 145 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42527  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4217  protein of unknown function DUF1025  37.5 
 
 		 145 aa  103  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.10125 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2790  hypothetical protein  38.28 
 
 		 133 aa  103  9e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.471985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3582  hypothetical protein  43.09 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1387  protein of unknown function DUF1025  46.97 
 
 		 140 aa  101  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0577698  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3024  hypothetical protein  35.66 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.500579 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0884  hypothetical protein  36.09 
 
 		 140 aa  100  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0828  hypothetical protein  36.09 
 
 		 148 aa  100  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3296  hypothetical protein  37.21 
 
 		 140 aa  100  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3115  hypothetical protein  40.15 
 
 		 138 aa  99.4  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0352  hypothetical protein  41.03 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2295  protein of unknown function DUF1025  43.75 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.29972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0865  hypothetical protein  44.7 
 
 		 140 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1823  hypothetical protein  43.75 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.369651  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2340  hypothetical protein  42.86 
 
 		 146 aa  87  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2619  protein of unknown function DUF1025  41.84 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498314  normal  0.0360571 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0237  hypothetical protein  34.96 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0040  hypothetical protein  38.39 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000897213  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0308  hypothetical protein  35.77 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.071647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5412  hypothetical protein  38.18 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.775255  normal  0.911338 
 
 
-
 
NC_002936  DET0044  hypothetical protein  35.9 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000336906  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5031  hypothetical protein  37.27 
 
 		 116 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5119  hypothetical protein  37.27 
 
 		 116 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_43  hypothetical protein  35.9 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000313292  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0230  protein of unknown function DUF1025  35.96 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2062  hypothetical protein  37.27 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.675767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01210  hypothetical protein  38.53 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0390  hypothetical protein  37.39 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1027  hypothetical protein  36.61 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000225372  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6886  hypothetical protein  32.14 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.363374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0611  protein of unknown function DUF1025  48.48 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1148  hypothetical protein  34.55 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0290997  normal  0.0149092 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4165  protein of unknown function DUF1025  36.36 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13870  hypothetical protein  31.3 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4291  hypothetical protein  36.94 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0544  protein of unknown function DUF1025  36.36 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3364  hypothetical protein  33.9 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3865  protein of unknown function DUF1025  36.89 
 
 		 380 aa  51.6  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.808766  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16220  hypothetical protein  37.31 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.181348  normal  0.61218 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34000  hypothetical protein  34.55 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113153  normal  0.79569 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1532  protein of unknown function DUF1025  29.31 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.174507 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25070  hypothetical protein  36.92 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2853  hypothetical protein  31.58 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.420761  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9058  hypothetical protein  40 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1391  protein of unknown function DUF1025  30.91 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.126034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0112  protein of unknown function DUF1025  39.45 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3083  protein of unknown function DUF1025  38.6 
 
 		 117 aa  48.9  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.912068  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0177  protein of unknown function DUF1025  31.78 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0272  protein of unknown function DUF1025  32.74 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4459  protein of unknown function DUF1025  33.04 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0147  protein of unknown function DUF1025  28.57 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4429  protein of unknown function DUF1025  30.09 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.827179  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0417  putative Zn-dependent protease  30.69 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.096636  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1564  protein of unknown function DUF1025  29.03 
 
 		 353 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0666104  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1469  protein of unknown function DUF1025  28.1 
 
 		 353 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01840  hypothetical protein  33.96 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2395  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 353 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>