85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0229 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0229  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  270  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00794732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0499  hypothetical protein  78.2 
 
 		 133 aa  226  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2790  hypothetical protein  76.69 
 
 		 133 aa  222  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.471985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0343  hypothetical protein  75.94 
 
 		 133 aa  220  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3590  hypothetical protein  74.24 
 
 		 133 aa  216  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0235  protein of unknown function DUF1025  74.05 
 
 		 137 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0352  hypothetical protein  77.31 
 
 		 120 aa  197  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1187  hypothetical protein  64.89 
 
 		 146 aa  177  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.518231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1145  protein of unknown function DUF1025  62.79 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108724 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2295  protein of unknown function DUF1025  62.79 
 
 		 146 aa  166  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.29972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1387  protein of unknown function DUF1025  61.19 
 
 		 140 aa  161  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0577698  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0865  hypothetical protein  61.65 
 
 		 140 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4376  hypothetical protein  55.3 
 
 		 147 aa  157  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.395833  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2619  protein of unknown function DUF1025  65.62 
 
 		 146 aa  157  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498314  normal  0.0360571 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2340  hypothetical protein  64.84 
 
 		 146 aa  157  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3115  hypothetical protein  57.69 
 
 		 138 aa  156  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1389  hypothetical protein  58.27 
 
 		 135 aa  154  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0828  hypothetical protein  55.38 
 
 		 148 aa  153  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0884  hypothetical protein  55.38 
 
 		 140 aa  153  8e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3296  hypothetical protein  53.85 
 
 		 140 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3893  protein of unknown function DUF1025  53.17 
 
 		 145 aa  147  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42527  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4217  protein of unknown function DUF1025  53.17 
 
 		 145 aa  147  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.10125 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3024  hypothetical protein  53.08 
 
 		 144 aa  147  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.500579 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3266  hypothetical protein  52.31 
 
 		 154 aa  144  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3582  hypothetical protein  54.03 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4833  hypothetical protein  48.46 
 
 		 165 aa  123  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2902  hypothetical protein  44.19 
 
 		 132 aa  113  6.9999999999999995e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0381  hypothetical protein  42.52 
 
 		 153 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0883  hypothetical protein  40.62 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00210212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1420  hypothetical protein  41.8 
 
 		 133 aa  103  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373567 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1823  hypothetical protein  44.09 
 
 		 139 aa  103  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.369651  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3637  hypothetical protein  39.52 
 
 		 133 aa  98.2  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.136644 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2456  hypothetical protein  42.52 
 
 		 136 aa  97.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0408545 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0798  neutral zinc metallopeptidase  42.52 
 
 		 136 aa  97.1  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0602  protein of unknown function DUF1025  42.52 
 
 		 133 aa  86.7  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.911931 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01210  hypothetical protein  39.45 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16220  hypothetical protein  29.37 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.181348  normal  0.61218 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3865  protein of unknown function DUF1025  36.84 
 
 		 380 aa  57.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.808766  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1471  hypothetical protein  33.91 
 
 		 355 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_43  hypothetical protein  34.31 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000313292  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0044  hypothetical protein  34.31 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000336906  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0040  hypothetical protein  34.31 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000897213  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1532  protein of unknown function DUF1025  31.4 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.174507 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4291  hypothetical protein  32.14 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1148  hypothetical protein  32.43 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0290997  normal  0.0149092 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0147  protein of unknown function DUF1025  35.71 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0177  protein of unknown function DUF1025  33.02 
 
 		 116 aa  52.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2395  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 353 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5031  hypothetical protein  30.28 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5119  hypothetical protein  30.28 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0308  hypothetical protein  27.97 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.071647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5412  hypothetical protein  37.18 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.775255  normal  0.911338 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1027  hypothetical protein  36.45 
 
 		 122 aa  50.8  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000225372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4429  protein of unknown function DUF1025  37.66 
 
 		 116 aa  50.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.827179  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1469  protein of unknown function DUF1025  33.33 
 
 		 353 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0390  hypothetical protein  30.43 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0230  protein of unknown function DUF1025  31.09 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1564  protein of unknown function DUF1025  33.33 
 
 		 353 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0666104  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13870  hypothetical protein  35.71 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0237  hypothetical protein  27.35 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25070  hypothetical protein  35.96 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0272  protein of unknown function DUF1025  33.91 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0611  protein of unknown function DUF1025  30.7 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665508 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6171  hypothetical protein  31.19 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4165  protein of unknown function DUF1025  33.33 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3364  hypothetical protein  40.91 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0141  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 419 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455814  normal  0.196734 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2062  hypothetical protein  31.68 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.675767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0417  putative Zn-dependent protease  28.83 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.096636  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6886  hypothetical protein  33.77 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.363374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4523  hypothetical protein  33.04 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.925489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9058  hypothetical protein  37.68 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1500  hypothetical protein  29.27 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2269  protein of unknown function DUF1025  33.85 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.553927 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0544  protein of unknown function DUF1025  33.33 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4459  protein of unknown function DUF1025  32.74 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0144  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.21 
 
 		 413 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0155  protein of unknown function DUF1025  29.21 
 
 		 413 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0137  hypothetical protein  29.21 
 
 		 413 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.327572  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1391  protein of unknown function DUF1025  26.32 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.126034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5033  hypothetical protein  33.04 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3505  protein of unknown function DUF1025  29.91 
 
 		 121 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.365915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0112  protein of unknown function DUF1025  31.19 
 
 		 116 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2901  protein of unknown function DUF1025  33.9 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.889781 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5659  protein of unknown function DUF1025  30.19 
 
 		 468 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.709029  normal  0.19565 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>