68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3590 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3590  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  273  6e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2790  hypothetical protein  87.88 
 
 		 133 aa  243  4e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.471985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0229  hypothetical protein  74.24 
 
 		 133 aa  216  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00794732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0499  hypothetical protein  73.48 
 
 		 133 aa  210  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0343  hypothetical protein  73.48 
 
 		 133 aa  207  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0235  protein of unknown function DUF1025  69.47 
 
 		 137 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0352  hypothetical protein  74.79 
 
 		 120 aa  196  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1187  hypothetical protein  63.36 
 
 		 146 aa  175  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.518231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1145  protein of unknown function DUF1025  60.47 
 
 		 141 aa  173  7e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108724 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0865  hypothetical protein  60.9 
 
 		 140 aa  164  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1389  hypothetical protein  60.61 
 
 		 135 aa  159  8.000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1387  protein of unknown function DUF1025  58.21 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0577698  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3115  hypothetical protein  56.15 
 
 		 138 aa  158  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2295  protein of unknown function DUF1025  58.14 
 
 		 146 aa  155  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.29972 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3024  hypothetical protein  56.59 
 
 		 144 aa  148  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.500579 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0828  hypothetical protein  53.85 
 
 		 148 aa  147  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4376  hypothetical protein  54.33 
 
 		 147 aa  147  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.395833  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0884  hypothetical protein  53.85 
 
 		 140 aa  147  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3296  hypothetical protein  53.08 
 
 		 140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4217  protein of unknown function DUF1025  53.97 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.10125 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3893  protein of unknown function DUF1025  53.97 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42527  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2619  protein of unknown function DUF1025  59.38 
 
 		 146 aa  144  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498314  normal  0.0360571 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2340  hypothetical protein  58.59 
 
 		 146 aa  144  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3266  hypothetical protein  51.18 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3582  hypothetical protein  51.61 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4833  hypothetical protein  46.97 
 
 		 165 aa  117  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2902  hypothetical protein  44.96 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0381  hypothetical protein  44.88 
 
 		 153 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0883  hypothetical protein  38.28 
 
 		 135 aa  104  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00210212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1420  hypothetical protein  40.98 
 
 		 133 aa  104  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373567 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2456  hypothetical protein  44.09 
 
 		 136 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0408545 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0798  neutral zinc metallopeptidase  44.09 
 
 		 136 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1823  hypothetical protein  43.31 
 
 		 139 aa  100  9e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.369651  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3637  hypothetical protein  37.4 
 
 		 133 aa  90.9  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.136644 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0602  protein of unknown function DUF1025  37.8 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.911931 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01210  hypothetical protein  32.73 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1469  protein of unknown function DUF1025  34.45 
 
 		 353 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2395  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 		 353 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1564  protein of unknown function DUF1025  34.45 
 
 		 353 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0666104  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1471  hypothetical protein  31.62 
 
 		 355 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0390  hypothetical protein  28.95 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0230  protein of unknown function DUF1025  31.3 
 
 		 115 aa  52.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1532  protein of unknown function DUF1025  30.33 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.174507 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3865  protein of unknown function DUF1025  34.19 
 
 		 380 aa  51.2  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.808766  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25070  hypothetical protein  33.05 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0147  protein of unknown function DUF1025  34.15 
 
 		 115 aa  48.9  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0177  protein of unknown function DUF1025  27.93 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16220  hypothetical protein  28.23 
 
 		 132 aa  47.4  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.181348  normal  0.61218 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_43  hypothetical protein  29.41 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000313292  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0417  putative Zn-dependent protease  33.67 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.096636  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0040  hypothetical protein  28.07 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000897213  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1148  hypothetical protein  27.52 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0290997  normal  0.0149092 
 
 
-
 
NC_002936  DET0044  hypothetical protein  29.36 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000336906  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4165  protein of unknown function DUF1025  29.82 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0308  hypothetical protein  24.79 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.071647 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0611  protein of unknown function DUF1025  26.72 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665508 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13870  hypothetical protein  32.81 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2062  hypothetical protein  29.25 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.675767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5119  hypothetical protein  26.61 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5031  hypothetical protein  26.61 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1027  hypothetical protein  30.97 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000225372  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4291  hypothetical protein  26.13 
 
 		 117 aa  43.5  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5412  hypothetical protein  34.67 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.775255  normal  0.911338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6171  hypothetical protein  35.94 
 
 		 113 aa  43.5  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6886  hypothetical protein  30.28 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.363374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0237  hypothetical protein  24.79 
 
 		 121 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4523  hypothetical protein  29.36 
 
 		 114 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.925489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4429  protein of unknown function DUF1025  31.08 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.827179  normal  0.0924411 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>