78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0352 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0352  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  245  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0229  hypothetical protein  77.31 
 
 		 133 aa  197  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00794732 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3590  hypothetical protein  74.79 
 
 		 133 aa  196  9e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0499  hypothetical protein  77.97 
 
 		 133 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2790  hypothetical protein  74.79 
 
 		 133 aa  194  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.471985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0235  protein of unknown function DUF1025  75.83 
 
 		 137 aa  193  9e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0343  hypothetical protein  75.42 
 
 		 133 aa  190  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1187  hypothetical protein  63.03 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.518231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1145  protein of unknown function DUF1025  60.5 
 
 		 141 aa  157  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108724 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0865  hypothetical protein  64.6 
 
 		 140 aa  157  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1387  protein of unknown function DUF1025  64.29 
 
 		 140 aa  153  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0577698  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2295  protein of unknown function DUF1025  63.89 
 
 		 146 aa  153  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.29972 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2619  protein of unknown function DUF1025  63.81 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498314  normal  0.0360571 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2340  hypothetical protein  62.86 
 
 		 146 aa  148  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3266  hypothetical protein  58.82 
 
 		 154 aa  141  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1389  hypothetical protein  58.47 
 
 		 135 aa  140  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3115  hypothetical protein  54.7 
 
 		 138 aa  138  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4376  hypothetical protein  57.14 
 
 		 147 aa  138  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.395833  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0884  hypothetical protein  51.67 
 
 		 140 aa  132  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0828  hypothetical protein  51.67 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3296  hypothetical protein  51.67 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3024  hypothetical protein  53.33 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.500579 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4217  protein of unknown function DUF1025  53.51 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.10125 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3893  protein of unknown function DUF1025  53.51 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42527  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3582  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  128  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4833  hypothetical protein  50.43 
 
 		 165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0381  hypothetical protein  45.3 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1823  hypothetical protein  48.25 
 
 		 139 aa  103  9e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.369651  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2902  hypothetical protein  43.22 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0883  hypothetical protein  41.03 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00210212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3637  hypothetical protein  41.03 
 
 		 133 aa  98.2  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.136644 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1420  hypothetical protein  40.52 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373567 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2456  hypothetical protein  43.59 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0408545 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0798  neutral zinc metallopeptidase  43.59 
 
 		 136 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0602  protein of unknown function DUF1025  46.32 
 
 		 133 aa  84.7  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.911931 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0040  hypothetical protein  33.03 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000897213  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_43  hypothetical protein  32.74 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000313292  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0044  hypothetical protein  33.96 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000336906  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01210  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3865  protein of unknown function DUF1025  36.61 
 
 		 380 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.808766  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0308  hypothetical protein  27.35 
 
 		 133 aa  52.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.071647 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0230  protein of unknown function DUF1025  35.35 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16220  hypothetical protein  29.09 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.181348  normal  0.61218 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4291  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0237  hypothetical protein  28.21 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0390  hypothetical protein  31.25 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0417  putative Zn-dependent protease  32.69 
 
 		 122 aa  50.8  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.096636  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1564  protein of unknown function DUF1025  32.38 
 
 		 353 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0666104  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2395  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 353 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1471  hypothetical protein  30.36 
 
 		 355 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5412  hypothetical protein  29.91 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.775255  normal  0.911338 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0147  protein of unknown function DUF1025  39.06 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1469  protein of unknown function DUF1025  31.43 
 
 		 353 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1532  protein of unknown function DUF1025  28.7 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.174507 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5119  hypothetical protein  28.97 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1148  hypothetical protein  39.13 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0290997  normal  0.0149092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5031  hypothetical protein  28.97 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4429  protein of unknown function DUF1025  36.36 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.827179  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0177  protein of unknown function DUF1025  42.19 
 
 		 116 aa  47.8  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13870  hypothetical protein  36.92 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6886  hypothetical protein  33.02 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.363374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25070  hypothetical protein  33.98 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4165  protein of unknown function DUF1025  31.73 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0611  protein of unknown function DUF1025  39.13 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665508 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2062  hypothetical protein  28.44 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.675767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1027  hypothetical protein  30.36 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000225372  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0141  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 419 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455814  normal  0.196734 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3364  hypothetical protein  36.99 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1391  protein of unknown function DUF1025  28.95 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.126034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6171  hypothetical protein  38.1 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4523  hypothetical protein  30.63 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.925489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9058  hypothetical protein  36.36 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2269  protein of unknown function DUF1025  25.49 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.553927 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0544  protein of unknown function DUF1025  34.69 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0144  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.34 
 
 		 413 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1500  hypothetical protein  29.52 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0155  protein of unknown function DUF1025  30.34 
 
 		 413 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0137  hypothetical protein  30.34 
 
 		 413 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.327572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>