42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0948 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0948  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  288  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.612685 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0890  hypothetical protein  95.3 
 
 		 149 aa  250  6e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.198874 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4300  hypothetical protein  69.01 
 
 		 151 aa  177  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6012  hypothetical protein  58.54 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2545  hypothetical protein  59.17 
 
 		 166 aa  130  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0462  hypothetical protein  53.85 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.163048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31040  hypothetical protein  51.8 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0137001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3844  hypothetical protein  59.5 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.231743  normal  0.0920086 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09090  protein of unknown function (DUF1025)  53.72 
 
 		 151 aa  114  6e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.284772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7606  hypothetical protein  57.02 
 
 		 167 aa  113  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2512  hypothetical protein  51.26 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.388702  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6329  hypothetical protein  57.38 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.143435  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0754  hypothetical protein  46.72 
 
 		 153 aa  104  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.308774  normal  0.0999942 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5860  hypothetical protein  51.68 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0355445  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1385  hypothetical protein  44.26 
 
 		 151 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3762  hypothetical protein  49.59 
 
 		 131 aa  100  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1214  hypothetical protein  50 
 
 		 118 aa  100  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.73902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0749  hypothetical protein  50.42 
 
 		 202 aa  97.4  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2343  protein of unknown function DUF1025  55.56 
 
 		 119 aa  97.1  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.477299  hitchhiker  0.0000202714 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1326  hypothetical protein  41.04 
 
 		 156 aa  92  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245288  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1343  hypothetical protein  41.04 
 
 		 156 aa  92  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.767989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1362  hypothetical protein  41.04 
 
 		 140 aa  92  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381038  normal  0.695527 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13288  hypothetical protein  39.29 
 
 		 175 aa  92  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.685983 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1858  hypothetical protein  42.98 
 
 		 121 aa  92  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0591439  hitchhiker  0.00875656 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3300  hypothetical protein  37.59 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282634  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1185  hypothetical protein  35.33 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676761  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4065  hypothetical protein  42.86 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202789  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1195  hypothetical protein  38.46 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4728  hypothetical protein  38.81 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0657063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1735  hypothetical protein  38.06 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733165 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1423  hypothetical protein  40.54 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0782655  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0592  hypothetical protein  34.07 
 
 		 142 aa  72  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4170  hypothetical protein  42.52 
 
 		 201 aa  70.5  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.550475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1266  hypothetical protein  35.9 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000357964 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20760  hypothetical protein  36.43 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0113453  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0758  hypothetical protein  31.03 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3893  protein of unknown function DUF1025  30.25 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42527  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4217  protein of unknown function DUF1025  30.51 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.10125 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3024  hypothetical protein  28.57 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.500579 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1564  protein of unknown function DUF1025  32.76 
 
 		 353 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0666104  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1471  hypothetical protein  31.71 
 
 		 355 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4376  hypothetical protein  27.73 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.395833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>