37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0749 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0749  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  391  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5860  hypothetical protein  83.13 
 
 		 190 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0355445  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0462  hypothetical protein  49.65 
 
 		 140 aa  132  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.163048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4300  hypothetical protein  52.03 
 
 		 151 aa  128  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0890  hypothetical protein  52.8 
 
 		 149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.198874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0948  hypothetical protein  52 
 
 		 149 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.612685 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31040  hypothetical protein  42.86 
 
 		 143 aa  104  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0137001  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3762  hypothetical protein  46.72 
 
 		 131 aa  102  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13288  hypothetical protein  41.67 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.685983 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2545  hypothetical protein  47.97 
 
 		 166 aa  102  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1385  hypothetical protein  42.4 
 
 		 151 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3844  hypothetical protein  50.83 
 
 		 144 aa  101  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.231743  normal  0.0920086 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2512  hypothetical protein  45.9 
 
 		 144 aa  101  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.388702  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09090  protein of unknown function (DUF1025)  48.76 
 
 		 151 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.284772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1362  hypothetical protein  40 
 
 		 140 aa  95.1  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381038  normal  0.695527 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1326  hypothetical protein  40 
 
 		 156 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245288  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7606  hypothetical protein  46.22 
 
 		 167 aa  95.1  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1343  hypothetical protein  40 
 
 		 156 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.767989 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1214  hypothetical protein  47.06 
 
 		 118 aa  94.7  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.73902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1858  hypothetical protein  45.53 
 
 		 121 aa  92.8  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0591439  hitchhiker  0.00875656 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2343  protein of unknown function DUF1025  52.59 
 
 		 119 aa  92  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.477299  hitchhiker  0.0000202714 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4065  hypothetical protein  41.67 
 
 		 155 aa  88.6  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202789  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1185  hypothetical protein  39.26 
 
 		 163 aa  87.8  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676761  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4728  hypothetical protein  40 
 
 		 140 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0657063  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0754  hypothetical protein  39.23 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.308774  normal  0.0999942 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3300  hypothetical protein  37.31 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282634  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1735  hypothetical protein  39.26 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733165 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1266  hypothetical protein  38.02 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000357964 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6012  hypothetical protein  41.73 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6329  hypothetical protein  43.75 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.143435  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1423  hypothetical protein  38.79 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0782655  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1195  hypothetical protein  36.44 
 
 		 122 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0592  hypothetical protein  32.86 
 
 		 142 aa  73.9  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4170  hypothetical protein  39.34 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.550475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20760  hypothetical protein  33.07 
 
 		 151 aa  67  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0113453  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0758  hypothetical protein  33.07 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4165  protein of unknown function DUF1025  29.81 
 
 		 118 aa  42  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>