40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3762 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3762  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  250  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2512  hypothetical protein  78.15 
 
 
144 aa  173  8e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.388702  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0462  hypothetical protein  50.76 
 
 
140 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.163048  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4300  hypothetical protein  50.68 
 
 
151 aa  118  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2545  hypothetical protein  55.17 
 
 
166 aa  118  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31040  hypothetical protein  47.86 
 
 
143 aa  113  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0137001  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0754  hypothetical protein  50 
 
 
153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.308774  normal  0.0999942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1385  hypothetical protein  46.72 
 
 
151 aa  110  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0890  hypothetical protein  51.18 
 
 
149 aa  105  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.198874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7606  hypothetical protein  54.31 
 
 
167 aa  104  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0749  hypothetical protein  46.72 
 
 
202 aa  103  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0948  hypothetical protein  50.39 
 
 
149 aa  103  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.612685 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3844  hypothetical protein  52.99 
 
 
144 aa  103  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.231743  normal  0.0920086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5860  hypothetical protein  45.08 
 
 
190 aa  100  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0355445  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09090  protein of unknown function (DUF1025)  45.76 
 
 
151 aa  97.8  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.284772 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2343  protein of unknown function DUF1025  54.46 
 
 
119 aa  97.4  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.477299  hitchhiker  0.0000202714 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1214  hypothetical protein  49.12 
 
 
118 aa  94.4  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.73902  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13288  hypothetical protein  40.28 
 
 
175 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.685983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1326  hypothetical protein  39.26 
 
 
156 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245288  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1362  hypothetical protein  39.26 
 
 
140 aa  91.7  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381038  normal  0.695527 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1343  hypothetical protein  39.26 
 
 
156 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.767989 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4065  hypothetical protein  48.46 
 
 
155 aa  90.5  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202789  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1185  hypothetical protein  36.62 
 
 
163 aa  89  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676761  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1858  hypothetical protein  39.32 
 
 
121 aa  88.6  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0591439  hitchhiker  0.00875656 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6012  hypothetical protein  44.09 
 
 
126 aa  85.1  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4170  hypothetical protein  42.31 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.550475  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0592  hypothetical protein  34.59 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1735  hypothetical protein  38.52 
 
 
140 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.733165 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20760  hypothetical protein  39.83 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0113453  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4728  hypothetical protein  39.26 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0657063  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6329  hypothetical protein  41.54 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.143435  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3300  hypothetical protein  33.82 
 
 
138 aa  77.4  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282634  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1266  hypothetical protein  38.39 
 
 
170 aa  72  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000357964 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1195  hypothetical protein  36.21 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1423  hypothetical protein  37.82 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0782655  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0758  hypothetical protein  36.61 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0230  protein of unknown function DUF1025  28.57 
 
 
115 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2062  hypothetical protein  30.77 
 
 
113 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.675767  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5119  hypothetical protein  32.38 
 
 
116 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354159  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5031  hypothetical protein  32.38 
 
 
116 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>