38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1423 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1423  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  292  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0782655  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0462  hypothetical protein  42.86 
 
 
140 aa  97.4  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.163048  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4300  hypothetical protein  42.11 
 
 
151 aa  90.9  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3844  hypothetical protein  47.93 
 
 
144 aa  90.1  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.231743  normal  0.0920086 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2545  hypothetical protein  43.9 
 
 
166 aa  87  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2343  protein of unknown function DUF1025  47.32 
 
 
119 aa  85.5  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.477299  hitchhiker  0.0000202714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1385  hypothetical protein  43.24 
 
 
151 aa  84.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0754  hypothetical protein  41.67 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.308774  normal  0.0999942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7606  hypothetical protein  44.64 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5860  hypothetical protein  39.66 
 
 
190 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0355445  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1858  hypothetical protein  37.07 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0591439  hitchhiker  0.00875656 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1214  hypothetical protein  42.37 
 
 
118 aa  80.9  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.73902  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0749  hypothetical protein  38.79 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31040  hypothetical protein  38.03 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0137001  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13288  hypothetical protein  36.73 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.685983 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1185  hypothetical protein  36.05 
 
 
163 aa  76.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676761  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09090  protein of unknown function (DUF1025)  37.96 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.284772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0890  hypothetical protein  41.44 
 
 
149 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.198874 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3300  hypothetical protein  35.77 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282634  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2512  hypothetical protein  38.94 
 
 
144 aa  72  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.388702  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20760  hypothetical protein  38.94 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0113453  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0948  hypothetical protein  40.54 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.612685 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1362  hypothetical protein  36.11 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381038  normal  0.695527 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1343  hypothetical protein  36.11 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.767989 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1326  hypothetical protein  36.11 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6012  hypothetical protein  38.1 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3762  hypothetical protein  37.82 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4065  hypothetical protein  40.62 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202789  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0592  hypothetical protein  31.58 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1195  hypothetical protein  32.52 
 
 
122 aa  62  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4728  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0657063  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1735  hypothetical protein  35.42 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.733165 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1266  hypothetical protein  31.09 
 
 
170 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000357964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6329  hypothetical protein  34.92 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.143435  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4170  hypothetical protein  32.5 
 
 
201 aa  55.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.550475  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0758  hypothetical protein  31.86 
 
 
120 aa  54.3  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01840  hypothetical protein  35.09 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2062  hypothetical protein  29.41 
 
 
113 aa  40.8  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.675767  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>