37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3844 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3844  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  270  4.0000000000000004e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.231743  normal  0.0920086 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2545  hypothetical protein  71.79 
 
 
166 aa  155  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09090  protein of unknown function (DUF1025)  61.98 
 
 
151 aa  142  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.284772 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2343  protein of unknown function DUF1025  73.28 
 
 
119 aa  140  8e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.477299  hitchhiker  0.0000202714 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0462  hypothetical protein  59.85 
 
 
140 aa  137  6e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.163048  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1214  hypothetical protein  63.48 
 
 
118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.73902  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4300  hypothetical protein  58.78 
 
 
151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1858  hypothetical protein  51.69 
 
 
121 aa  123  9e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0591439  hitchhiker  0.00875656 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0890  hypothetical protein  61.42 
 
 
149 aa  122  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.198874 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1385  hypothetical protein  55.56 
 
 
151 aa  121  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0948  hypothetical protein  60.63 
 
 
149 aa  121  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.612685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7606  hypothetical protein  57.76 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0754  hypothetical protein  55.38 
 
 
153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.308774  normal  0.0999942 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20760  hypothetical protein  53.45 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0113453  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5860  hypothetical protein  54.17 
 
 
190 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0355445  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31040  hypothetical protein  49.29 
 
 
143 aa  106  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0137001  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3762  hypothetical protein  52.99 
 
 
131 aa  102  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0749  hypothetical protein  50.83 
 
 
202 aa  103  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2512  hypothetical protein  52.14 
 
 
144 aa  102  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.388702  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0592  hypothetical protein  41.35 
 
 
142 aa  99  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6012  hypothetical protein  52.38 
 
 
126 aa  95.9  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13288  hypothetical protein  43.06 
 
 
175 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.685983 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4065  hypothetical protein  48.85 
 
 
155 aa  93.2  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202789  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6329  hypothetical protein  54.47 
 
 
150 aa  92  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.143435  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0758  hypothetical protein  45.61 
 
 
120 aa  90.1  8e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1423  hypothetical protein  49.56 
 
 
150 aa  90.5  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0782655  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1343  hypothetical protein  42.96 
 
 
156 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.767989 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1326  hypothetical protein  42.96 
 
 
156 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245288  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1362  hypothetical protein  42.96 
 
 
140 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381038  normal  0.695527 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4170  hypothetical protein  51.3 
 
 
201 aa  86.7  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.550475  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1185  hypothetical protein  41.22 
 
 
163 aa  85.9  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676761  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3300  hypothetical protein  43.28 
 
 
138 aa  85.1  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282634  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1266  hypothetical protein  40.32 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000357964 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1195  hypothetical protein  41.18 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4728  hypothetical protein  42.96 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0657063  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1735  hypothetical protein  42.96 
 
 
140 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.733165 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3266  hypothetical protein  42.59 
 
 
154 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>