39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1185 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1185  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  313  5e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676761  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3300  hypothetical protein  57.25 
 
 		 138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282634  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1326  hypothetical protein  53.91 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245288  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1343  hypothetical protein  53.91 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.767989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1362  hypothetical protein  51.88 
 
 		 140 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381038  normal  0.695527 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13288  hypothetical protein  54.14 
 
 		 175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.685983 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1735  hypothetical protein  53.38 
 
 		 140 aa  143  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733165 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4728  hypothetical protein  52.63 
 
 		 140 aa  142  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0657063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31040  hypothetical protein  48.25 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0137001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4170  hypothetical protein  44.19 
 
 		 201 aa  108  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.550475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4300  hypothetical protein  38.46 
 
 		 151 aa  87.4  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6329  hypothetical protein  46.4 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.143435  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0462  hypothetical protein  35.71 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.163048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0749  hypothetical protein  37.9 
 
 		 202 aa  77.8  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3762  hypothetical protein  34.85 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5860  hypothetical protein  37.9 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0355445  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3844  hypothetical protein  39.84 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.231743  normal  0.0920086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0948  hypothetical protein  35.43 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.612685 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0890  hypothetical protein  33.83 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.198874 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2545  hypothetical protein  35.94 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2512  hypothetical protein  32.31 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.388702  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1423  hypothetical protein  35.38 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0782655  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09090  protein of unknown function (DUF1025)  34.68 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.284772 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1214  hypothetical protein  34.68 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.73902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7606  hypothetical protein  31.62 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0754  hypothetical protein  32.85 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.308774  normal  0.0999942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6012  hypothetical protein  32.06 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1385  hypothetical protein  32.85 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1858  hypothetical protein  34.96 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0591439  hitchhiker  0.00875656 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2343  protein of unknown function DUF1025  38.21 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.477299  hitchhiker  0.0000202714 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20760  hypothetical protein  32.58 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0113453  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0592  hypothetical protein  31.16 
 
 		 142 aa  50.8  0.000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4065  hypothetical protein  29.66 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202789  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1195  hypothetical protein  28 
 
 		 122 aa  48.1  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1471  hypothetical protein  29.17 
 
 		 355 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1266  hypothetical protein  25.81 
 
 		 170 aa  44.3  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000357964 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0758  hypothetical protein  31.36 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1469  protein of unknown function DUF1025  38.3 
 
 		 353 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1564  protein of unknown function DUF1025  38.3 
 
 		 353 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0666104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>