31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0592 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0592  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  293  7e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0758  hypothetical protein  64.17 
 
 		 120 aa  163  6.9999999999999995e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09090  protein of unknown function (DUF1025)  39.5 
 
 		 151 aa  95.5  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.284772 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0462  hypothetical protein  37.88 
 
 		 140 aa  90.5  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.163048  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2343  protein of unknown function DUF1025  40.35 
 
 		 119 aa  87.4  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.477299  hitchhiker  0.0000202714 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1214  hypothetical protein  36.52 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.73902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2545  hypothetical protein  38.74 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1858  hypothetical protein  36.61 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0591439  hitchhiker  0.00875656 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4300  hypothetical protein  36.11 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3844  hypothetical protein  38.33 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.231743  normal  0.0920086 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20760  hypothetical protein  33.62 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0113453  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3762  hypothetical protein  32.52 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1195  hypothetical protein  36.61 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31040  hypothetical protein  30.71 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0137001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0749  hypothetical protein  32.23 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5860  hypothetical protein  33.06 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0355445  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1385  hypothetical protein  29.84 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7606  hypothetical protein  31.03 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0754  hypothetical protein  29.03 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.308774  normal  0.0999942 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0890  hypothetical protein  31.2 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.198874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0948  hypothetical protein  31.2 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.612685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6012  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1266  hypothetical protein  31.53 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000357964 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1423  hypothetical protein  30.91 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0782655  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2512  hypothetical protein  28.81 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.388702  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1185  hypothetical protein  31.16 
 
 		 163 aa  50.8  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676761  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4065  hypothetical protein  29.77 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202789  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4170  hypothetical protein  27.48 
 
 		 201 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.550475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13288  hypothetical protein  26.43 
 
 		 175 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.685983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1362  hypothetical protein  26.67 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381038  normal  0.695527 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6329  hypothetical protein  26.02 
 
 		 150 aa  40  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.143435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>