51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2343 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2343  protein of unknown function DUF1025  100 
 
 
119 aa  231  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.477299  hitchhiker  0.0000202714 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2545  hypothetical protein  75.86 
 
 
166 aa  172  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09090  protein of unknown function (DUF1025)  71.3 
 
 
151 aa  170  5.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.284772 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1214  hypothetical protein  73.73 
 
 
118 aa  168  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.73902  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3844  hypothetical protein  74.14 
 
 
144 aa  156  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.231743  normal  0.0920086 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1858  hypothetical protein  61.21 
 
 
121 aa  142  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0591439  hitchhiker  0.00875656 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0462  hypothetical protein  60.34 
 
 
140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.163048  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0754  hypothetical protein  56.78 
 
 
153 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.308774  normal  0.0999942 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0890  hypothetical protein  56.41 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.198874 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4300  hypothetical protein  57.94 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0948  hypothetical protein  55.56 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.612685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7606  hypothetical protein  60.91 
 
 
167 aa  114  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0749  hypothetical protein  52.59 
 
 
202 aa  110  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1385  hypothetical protein  50.85 
 
 
151 aa  110  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3762  hypothetical protein  54.46 
 
 
131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5860  hypothetical protein  50.86 
 
 
190 aa  106  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0355445  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2512  hypothetical protein  53.57 
 
 
144 aa  105  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.388702  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20760  hypothetical protein  51.35 
 
 
151 aa  105  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0113453  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6012  hypothetical protein  51.59 
 
 
126 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0758  hypothetical protein  43.86 
 
 
120 aa  99.4  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4065  hypothetical protein  52.42 
 
 
155 aa  96.3  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202789  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1423  hypothetical protein  47.32 
 
 
150 aa  93.6  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0782655  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1195  hypothetical protein  42.61 
 
 
122 aa  92.8  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0592  hypothetical protein  40.35 
 
 
142 aa  92  3e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1266  hypothetical protein  43.36 
 
 
170 aa  92  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000357964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6329  hypothetical protein  50.85 
 
 
150 aa  87  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.143435  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4170  hypothetical protein  48.8 
 
 
201 aa  86.3  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.550475  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31040  hypothetical protein  45.16 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0137001  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1326  hypothetical protein  38.93 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245288  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1362  hypothetical protein  38.93 
 
 
140 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381038  normal  0.695527 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1343  hypothetical protein  38.93 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.767989 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3300  hypothetical protein  37.3 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282634  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13288  hypothetical protein  35.11 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.685983 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1185  hypothetical protein  37.6 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676761  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1735  hypothetical protein  36.64 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.733165 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4728  hypothetical protein  35.88 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0657063  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2062  hypothetical protein  33 
 
 
113 aa  53.9  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.675767  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4165  protein of unknown function DUF1025  39.22 
 
 
118 aa  53.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0544  protein of unknown function DUF1025  33 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6886  hypothetical protein  32.04 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.363374  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0230  protein of unknown function DUF1025  28.44 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25070  hypothetical protein  31.53 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01210  hypothetical protein  32.08 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3364  hypothetical protein  32.29 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1027  hypothetical protein  32.17 
 
 
122 aa  41.6  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000225372  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3024  hypothetical protein  27.5 
 
 
144 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.500579 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1391  protein of unknown function DUF1025  26.13 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.126034  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01840  hypothetical protein  30.56 
 
 
131 aa  41.2  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5119  hypothetical protein  30.77 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354159  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5412  hypothetical protein  30.77 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.775255  normal  0.911338 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5031  hypothetical protein  30.77 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>