More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_B0110 on replicon NC_009705
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009705  YpsIP31758_B0110  type IV secretion system protein DotB  100 
 
 		 387 aa  801    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0132297  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2730  defect in organelle trafficking protein DotB (ATPase)  38.1 
 
 		 377 aa  225  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2603  defect in organelle trafficking protein DotB (ATPase)  38.1 
 
 		 377 aa  225  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0350  ATP-binding protein  36.96 
 
 		 372 aa  223  4e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1833  Dot/Icm secretion system ATPase DotB  36.68 
 
 		 372 aa  221  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5603  type II secretion system protein E  31.32 
 
 		 393 aa  210  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489222  normal  0.0238979 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4279  type II secretion system protein E  30.71 
 
 		 403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0101  plasmid transfer ATPase TraJ  30.72 
 
 		 382 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0335  twitching motility protein PilT  32.73 
 
 		 398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3033  twitching motility protein  32.47 
 
 		 391 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0402494  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2195  twitching motility protein  29.23 
 
 		 390 aa  140  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2906  pilus retraction protein PilT  31.82 
 
 		 389 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.146208 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2412  twitching motility protein  33.44 
 
 		 372 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1251  pilus retraction protein PilT  32.26 
 
 		 360 aa  138  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3084  twitching motility protein  35.84 
 
 		 360 aa  138  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0672592 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  31.2 
 
 		 358 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0210  twitching motility protein  31.19 
 
 		 399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0964904  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  38.01 
 
 		 345 aa  136  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  38.46 
 
 		 345 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1362  Sodium:galactoside symporter  30.99 
 
 		 397 aa  136  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2517  twitching motility protein  27.64 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0242978 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  31.17 
 
 		 346 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1725  pilus retraction protein PilT  33.12 
 
 		 395 aa  134  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.544613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  38.32 
 
 		 349 aa  134  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1805  hypothetical protein  30.46 
 
 		 392 aa  134  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00695665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  32.81 
 
 		 344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  31.17 
 
 		 346 aa  133  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1305  twitching mobility protein  30.37 
 
 		 402 aa  133  6e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  31.49 
 
 		 345 aa  133  6e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2045  twitching motility protein  32.57 
 
 		 395 aa  133  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.398089  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2916  type II secretion system protein (twitching motility protein)  32.04 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465688  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1917  twitching motility protein  33.44 
 
 		 360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.979204 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  36.82 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  30.14 
 
 		 360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  32.19 
 
 		 345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  31.87 
 
 		 345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0505  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  37.44 
 
 		 347 aa  130  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  31.87 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  31.87 
 
 		 345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  31.56 
 
 		 345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  31.56 
 
 		 345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  31.56 
 
 		 345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  31.56 
 
 		 345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  37.1 
 
 		 344 aa  130  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  31.87 
 
 		 345 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1361  pilus retraction protein PilT  30.45 
 
 		 390 aa  130  6e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.678263  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2680  twitching motility protein  30.99 
 
 		 370 aa  129  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.595329  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  36.49 
 
 		 345 aa  129  8.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3661  twitching motility protein PilU  31.12 
 
 		 375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454931  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  31.56 
 
 		 345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2026  twitching motility protein  29.47 
 
 		 409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.166451 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3053  twitching motility protein  36.82 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39006  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  29.62 
 
 		 345 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  31.56 
 
 		 345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  31.56 
 
 		 345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1334  twitching motility protein  31.1 
 
 		 370 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  30.84 
 
 		 345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  31.56 
 
 		 345 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  37.39 
 
 		 349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0689  twitching motility protein  34.6 
 
 		 391 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  37.56 
 
 		 345 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0494  type II secretion system protein (twitching motility protein)  28.97 
 
 		 375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0124637  normal  0.766223 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  37.04 
 
 		 347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1196  twitching motility protein  31.83 
 
 		 370 aa  127  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0761458  normal  0.595068 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  33.22 
 
 		 437 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3350  twitching motility protein PilU  31.49 
 
 		 370 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1195  twitching motility protein  31.49 
 
 		 370 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0633873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1266  twitching motility protein  31.49 
 
 		 370 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1543  twitching motility protein  33.18 
 
 		 423 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  31.75 
 
 		 397 aa  126  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  37.07 
 
 		 345 aa  126  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  35 
 
 		 344 aa  126  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3004  pilus retraction protein PilT  37.09 
 
 		 345 aa  126  7e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  31.28 
 
 		 350 aa  126  7e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  32.06 
 
 		 382 aa  125  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2414  twitching motility protein  31.46 
 
 		 344 aa  125  9e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  38.16 
 
 		 347 aa  125  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0245  twitching motility protein  32.73 
 
 		 359 aa  125  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.292052  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0267  pilus retraction protein PilT  37.27 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3082  pilus retraction protein PilT  28.81 
 
 		 370 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.184525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1139  twitching motility protein  31.83 
 
 		 370 aa  125  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0768436 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  35.21 
 
 		 362 aa  125  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  36.2 
 
 		 347 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3038  twitching motility protein  31 
 
 		 370 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000184557  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2420  pilus retraction protein PilT  30.1 
 
 		 377 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  36.2 
 
 		 347 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  32.45 
 
 		 427 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1995  twitching motility protein  29.8 
 
 		 401 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.206221 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0293  twitching motility protein  36.82 
 
 		 350 aa  125  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3181  twitching motility protein  31 
 
 		 370 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000438946  normal  0.0177066 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1167  twitching motility protein  35.19 
 
 		 375 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.69165  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  36.04 
 
 		 347 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2685  twitching motility protein  30.8 
 
 		 370 aa  124  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  38.16 
 
 		 347 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1340  twitching motility protein  30.67 
 
 		 370 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0289531  hitchhiker  0.0000000718635 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  38.78 
 
 		 344 aa  124  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1129  twitching motility protein  31.03 
 
 		 370 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0511874  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  32.45 
 
 		 427 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  31.01 
 
 		 350 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1609  twitching motility protein  34.84 
 
 		 345 aa  124  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409997 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>