More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1806 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  100 
 
 		 292 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  99.32 
 
 		 292 aa  577  1e-164  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  78.65 
 
 		 320 aa  426  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  76.28 
 
 		 314 aa  394  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  35.74 
 
 		 291 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  35.74 
 
 		 306 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  36.5 
 
 		 299 aa  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  35.55 
 
 		 360 aa  156  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  31.58 
 
 		 324 aa  154  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  35.47 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  35.02 
 
 		 436 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  35.03 
 
 		 311 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  33.45 
 
 		 307 aa  152  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  33.45 
 
 		 443 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  35.71 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  35.71 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  35.69 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  29.97 
 
 		 317 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  31.27 
 
 		 424 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  35.36 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  34.18 
 
 		 341 aa  149  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  34.26 
 
 		 310 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  34.26 
 
 		 310 aa  148  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  32.86 
 
 		 311 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  34.59 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  31.8 
 
 		 305 aa  146  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  32.73 
 
 		 321 aa  145  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  34.67 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  34.87 
 
 		 347 aa  142  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  35.6 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  35.91 
 
 		 411 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  34.44 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  34.44 
 
 		 337 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  34.44 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  34.33 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  34.44 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  33.58 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  34.66 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  33.58 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  34.27 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  34.62 
 
 		 312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  31.27 
 
 		 427 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  32.6 
 
 		 370 aa  132  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  33.73 
 
 		 298 aa  132  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  30.88 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  29.21 
 
 		 323 aa  129  6e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  33.33 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  32.13 
 
 		 304 aa  125  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  34.8 
 
 		 329 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  31.41 
 
 		 329 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  31.41 
 
 		 329 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  31.75 
 
 		 301 aa  122  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  40.51 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  31.92 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  33.09 
 
 		 305 aa  116  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  34.44 
 
 		 393 aa  112  8.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  31.93 
 
 		 326 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  34.66 
 
 		 303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  33 
 
 		 331 aa  109  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  34.93 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  28.37 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  31.5 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  33.71 
 
 		 305 aa  96.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  33.71 
 
 		 305 aa  96.7  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  26.62 
 
 		 276 aa  95.5  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  33.79 
 
 		 309 aa  95.5  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1406  ribonuclease BN  31.6 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.573356  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  23.57 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  28.72 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  24.64 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2769  putative ribonuclease BN  26.67 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  25.91 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  24.64 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  29.03 
 
 		 447 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1830  ribonuclease BN, putative  25.35 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0291213 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  29.14 
 
 		 444 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.12 
 
 		 428 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000260717  hitchhiker  0.000176219 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  29.48 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1457  ribonuclease BN  26.33 
 
 		 484 aa  72.4  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  25.9 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4966  ribonuclease BN  27.2 
 
 		 448 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  29.55 
 
 		 437 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  25.86 
 
 		 439 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  23.67 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1559  putative ribonuclease BN transmembrane protein  28.63 
 
 		 441 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  26.54 
 
 		 332 aa  68.9  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  24.88 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  26.62 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001900  ribonuclease BN  29.26 
 
 		 314 aa  68.9  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.886374  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  25.43 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  24.14 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  27.31 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2776  putative ribonuclease BN  26.46 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  26.77 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  23.61 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  23.61 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  23.61 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  30.98 
 
 		 442 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  24.92 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>