171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3204 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3204  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 
215 aa  412  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.78222  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6883  phosphoglycolate phosphatase  65.35 
 
 
219 aa  255  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2329  HAD-superfamily hydrolase  66.03 
 
 
217 aa  245  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.480139 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0577  HAD family hydrolase  58.37 
 
 
216 aa  230  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0396  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  53.92 
 
 
223 aa  200  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1142  HAD family hydrolase  48.37 
 
 
218 aa  182  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1995  HAD family hydrolase  48.44 
 
 
215 aa  169  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.273033 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0310  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  46.45 
 
 
222 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  47.17 
 
 
220 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  46.67 
 
 
219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6763  HAD family hydrolase  48.4 
 
 
216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2725  HAD-superfamily hydrolase  45.79 
 
 
224 aa  159  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305002  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4488  HAD family hydrolase  47.42 
 
 
219 aa  159  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1637  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  47.14 
 
 
222 aa  154  8e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1941  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.86 
 
 
230 aa  153  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139802  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2155  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  41.33 
 
 
235 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  32.67 
 
 
234 aa  62.8  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  32.67 
 
 
234 aa  62.8  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  31.68 
 
 
234 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.83 
 
 
250 aa  61.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335039  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  44.12 
 
 
259 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.644028  normal  0.407764 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2677  HAD family hydrolase  34.53 
 
 
222 aa  59.7  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4115  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.11 
 
 
237 aa  59.3  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  24.79 
 
 
225 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  35.16 
 
 
236 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  26.87 
 
 
231 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  24.58 
 
 
225 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.85 
 
 
227 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  27.48 
 
 
225 aa  55.1  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  26.32 
 
 
225 aa  55.5  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  40.38 
 
 
234 aa  54.3  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  28.24 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.58 
 
 
244 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0234  HAD family hydrolase  32.58 
 
 
225 aa  53.1  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.961854 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  32.33 
 
 
234 aa  52.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  28.24 
 
 
224 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  26.72 
 
 
223 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4215  HAD family hydrolase  33.59 
 
 
226 aa  52.8  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.01 
 
 
224 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  29.01 
 
 
224 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  26.72 
 
 
223 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3656  phosphoglycolate phosphatase  35.38 
 
 
234 aa  52  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.03 
 
 
263 aa  52  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  29.87 
 
 
227 aa  51.6  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  27.48 
 
 
224 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  29.41 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  30.1 
 
 
207 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4225  HAD family hydrolase  38.24 
 
 
247 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0557  haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  26.75 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.262309  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3660  hydrolase  33.01 
 
 
234 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.150551 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  32.02 
 
 
234 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3108  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  30.69 
 
 
215 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4524  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.24 
 
 
203 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655556  normal  0.0295033 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  28.29 
 
 
220 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4681  HAD superfamily hydrolase  33.98 
 
 
128 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  30.49 
 
 
226 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2371  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.57 
 
 
236 aa  49.3  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2874  HAD family hydrolase  27.68 
 
 
231 aa  48.9  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.5302  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  33.98 
 
 
224 aa  49.3  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  33.83 
 
 
228 aa  48.9  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0732  HAD family hydrolase  34.09 
 
 
225 aa  48.5  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.447579  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2014  HAD family hydrolase  38.1 
 
 
231 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0599  HAD family hydrolase  38.3 
 
 
271 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.559582  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1170  HAD family hydrolase  35.61 
 
 
238 aa  47.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.382676  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0612  HAD family hydrolase  38.3 
 
 
271 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0590  HAD family hydrolase  38.3 
 
 
271 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  28.83 
 
 
226 aa  47.8  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1396  haloacid dehalogenase, type II  27.93 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.430532  normal  0.787834 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  30.71 
 
 
238 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  27.1 
 
 
228 aa  47  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  30.71 
 
 
238 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.38 
 
 
268 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  30.69 
 
 
239 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  30.69 
 
 
239 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2832  HAD family hydrolase  34.06 
 
 
248 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106168  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0133  HAD family hydrolase  29.08 
 
 
231 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1751  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.29 
 
 
230 aa  46.6  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000165887  normal  0.0449788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2631  HAD family hydrolase  27.97 
 
 
235 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  31.37 
 
 
242 aa  46.2  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  30.86 
 
 
221 aa  46.2  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  34.48 
 
 
223 aa  46.2  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0261  HAD family hydrolase  34.65 
 
 
245 aa  46.2  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1991  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.52 
 
 
219 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117444  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  45 
 
 
231 aa  45.4  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5409  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.64 
 
 
267 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.470788 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_7222  predicted protein  35.11 
 
 
205 aa  45.4  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.74166  normal  0.591423 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2015  HAD family hydrolase  32.46 
 
 
237 aa  45.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  31.75 
 
 
256 aa  45.4  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  29.6 
 
 
226 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  28.71 
 
 
218 aa  45.1  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  30.95 
 
 
251 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3482  HAD family hydrolase  31.29 
 
 
240 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894604  normal  0.0749599 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0678  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  35.87 
 
 
264 aa  45.1  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0796  HAD family hydrolase  28.89 
 
 
231 aa  45.1  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4259  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.96 
 
 
203 aa  45.1  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  29.94 
 
 
242 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6497  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.32 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121747  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  32.85 
 
 
224 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1166  HAD family hydrolase  36.36 
 
 
229 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.779812  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>