More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2826 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2826  ROK family protein  100 
 
 		 403 aa  780    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0465  ROK family protein  48.51 
 
 		 410 aa  354  1e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06180  transcriptional regulator/sugar kinase  54 
 
 		 406 aa  349  6e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0180  ROK family protein  49.36 
 
 		 404 aa  308  8e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0646  ROK family protein  47.19 
 
 		 438 aa  280  4e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0223419  hitchhiker  0.00474804 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  44.16 
 
 		 382 aa  242  7.999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  42.41 
 
 		 391 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4664  ROK family protein  43.72 
 
 		 409 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213413  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6688  ROK family protein  43.03 
 
 		 406 aa  230  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.395851 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  37.82 
 
 		 413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2986  ROK family protein  48.63 
 
 		 398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.132315  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1887  NagC family Transcriptional regulator  33.5 
 
 		 409 aa  212  7e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103401  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3308  ROK family protein  42.23 
 
 		 383 aa  205  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0139396 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01680  transcriptional regulator/sugar kinase  35.99 
 
 		 392 aa  188  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  44.96 
 
 		 473 aa  188  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  39.04 
 
 		 448 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2174  ROK family protein  37.35 
 
 		 409 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000419301 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  38.83 
 
 		 403 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  33.59 
 
 		 417 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3783  ROK family protein  34.84 
 
 		 457 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00347065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  37.26 
 
 		 401 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2271  ROK family protein  33.83 
 
 		 401 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0826731 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2429  ROK family protein  37.81 
 
 		 418 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  34.44 
 
 		 395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  32.67 
 
 		 418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  31.78 
 
 		 389 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  33.99 
 
 		 417 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6738  ROK family protein  33.58 
 
 		 413 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7617  transcriptional regulator, ROK family  32.92 
 
 		 408 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.451753  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  30.96 
 
 		 409 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  32.65 
 
 		 436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  36.59 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2670  ROK family protein  32.84 
 
 		 408 aa  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000218357  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  32.36 
 
 		 397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  32.21 
 
 		 395 aa  135  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  30.93 
 
 		 399 aa  134  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  31.45 
 
 		 404 aa  133  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3849  ROK family protein  32.07 
 
 		 393 aa  133  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5021  ROK family protein  34.88 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  32.51 
 
 		 398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  28.65 
 
 		 434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  33.33 
 
 		 408 aa  131  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4239  ROK family protein  31.06 
 
 		 393 aa  131  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397832  normal  0.0388456 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  27.55 
 
 		 399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  34.31 
 
 		 383 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0225  ROK family protein  27.11 
 
 		 398 aa  130  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  28.65 
 
 		 405 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  35.15 
 
 		 390 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  34.78 
 
 		 410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  30.5 
 
 		 404 aa  126  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  35.2 
 
 		 418 aa  126  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  26.2 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  28.57 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  32.97 
 
 		 416 aa  125  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  30.69 
 
 		 404 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4482  ROK family protein  31.78 
 
 		 385 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  26.77 
 
 		 396 aa  123  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  26.65 
 
 		 391 aa  123  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0694  ROK family protein  38.06 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0157817 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  29.85 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1506  ROK family protein  32.13 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.809262  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  27.11 
 
 		 396 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  32.88 
 
 		 406 aa  121  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  29.62 
 
 		 404 aa  121  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  32.34 
 
 		 401 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0233  ROK family protein  33.24 
 
 		 385 aa  119  7e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  28.79 
 
 		 435 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  24.92 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  32.71 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28270  transcriptional regulator/sugar kinase  31.76 
 
 		 434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  32.56 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  33.23 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17010  transcriptional regulator/sugar kinase  34.7 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.578503 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1271  ROK family protein  31.68 
 
 		 361 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0499308  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  29.78 
 
 		 414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  29.12 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  24.43 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  25 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  29.61 
 
 		 428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  26.79 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  30.45 
 
 		 425 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  34.31 
 
 		 390 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  24.69 
 
 		 396 aa  112  8.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  30.45 
 
 		 425 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  32.85 
 
 		 400 aa  112  9e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  29.1 
 
 		 391 aa  112  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  27.42 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1730  transcriptional repressor of the xylose operon  33.75 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.332399  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  24.24 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5946  ROK family protein  28.5 
 
 		 422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  30.65 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3115  ROK domain-containing protein  29.56 
 
 		 442 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.603125  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  32.8 
 
 		 381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  30.41 
 
 		 425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  28.49 
 
 		 410 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  22.67 
 
 		 385 aa  110  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  31.16 
 
 		 389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  27.76 
 
 		 389 aa  110  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  26.18 
 
 		 399 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>