More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0854 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0854  secretion protein, HlyD family  100 
 
 		 355 aa  726    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3421  secretion protein HlyD family protein  54.93 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003056  multidrug resistance efflux pump  50.85 
 
 		 354 aa  381  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1922  putative secretion protein  37.32 
 
 		 352 aa  232  9e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.350585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0505  secretion protein HlyD family protein  38.1 
 
 		 354 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3251  secretion protein HlyD family protein  37.5 
 
 		 356 aa  226  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482288  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000534  putative secretion protein  37.04 
 
 		 352 aa  226  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02789  putative efflux pump protein  37.57 
 
 		 344 aa  225  7e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3609  secretion protein HlyD family protein  37.61 
 
 		 352 aa  219  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0541  secretion protein HlyD family protein  37.32 
 
 		 352 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3771  secretion protein HlyD family protein  37.32 
 
 		 352 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0565  secretion protein HlyD family protein  37.32 
 
 		 352 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0570  secretion protein HlyD family protein  37.32 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3434  secretion protein HlyD family protein  36.75 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0517  secretion protein HlyD family protein  36.75 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0621  secretion protein HlyD family protein  37.32 
 
 		 352 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.602249  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4051  HlyD family secretion protein  37.08 
 
 		 357 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07032  hypothetical protein  36.72 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2397  secretion protein HlyD family protein  36.06 
 
 		 368 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.584067  decreased coverage  0.00226725 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1783  secretion protein HlyD family protein  37.04 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1770  putative secretion protein  35.04 
 
 		 352 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20620  HlyD family secretion protein  34.76 
 
 		 352 aa  209  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0045141  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1216  secretion protein HlyD family protein  33.24 
 
 		 383 aa  204  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0651482  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  32.49 
 
 		 378 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0683  secretion protein HlyD family protein  33.61 
 
 		 354 aa  196  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346077 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  32.76 
 
 		 377 aa  196  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2138  secretion protein HlyD  30.94 
 
 		 365 aa  192  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953657 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  32.77 
 
 		 354 aa  186  7e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1552  secretion protein HlyD family protein  33.72 
 
 		 349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6454  secretion protein HlyD family protein  33.05 
 
 		 386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.134299 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1904  secretion protein, HlyD family  32.63 
 
 		 373 aa  182  7e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382262  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2821  secretion protein HlyD family protein  32.58 
 
 		 364 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2912  secretion protein HlyD family protein  33.14 
 
 		 364 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5668  secretion protein HlyD family protein  34.45 
 
 		 367 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0253  secretion protein HlyD family protein  32.31 
 
 		 368 aa  180  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.195856 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1739  secretion protein HlyD  32.05 
 
 		 381 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.963287  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2743  secretion protein HlyD family protein  32.1 
 
 		 364 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4163  HlyD family secretion protein  30.9 
 
 		 373 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0754  secretion protein HlyD family protein  31.56 
 
 		 365 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3625  secretion protein HlyD  35.39 
 
 		 354 aa  176  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.110233  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0716  secretion protein HlyD family protein  32.19 
 
 		 365 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0750  secretion protein HlyD family protein  31.81 
 
 		 365 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4467  secretion protein HlyD family protein  31.34 
 
 		 361 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0947409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1000  multidrug resistance efflux pump  31.67 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2293  secretion protein  30.09 
 
 		 365 aa  142  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  28.4 
 
 		 374 aa  122  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06917  hypothetical protein  27.19 
 
 		 356 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0434  secretion protein, HlyD family  28.8 
 
 		 376 aa  119  7.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  31.17 
 
 		 355 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05111  hypothetical protein  29.26 
 
 		 376 aa  116  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3790  membrane fusion protein family protein  25.66 
 
 		 378 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0123  secretion protein HlyD family protein  25.66 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3911  membrane fusion protein family protein  25.72 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001244  multidrug resistance efflux pump  28.94 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0127  secretion protein HlyD family protein  25.66 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4082  membrane fusion protein family protein  25.66 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03441  membrane fusion protein (MFP) component of efflux pump, signal anchor  25.66 
 
 		 378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03392  hypothetical protein  25.66 
 
 		 378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4954  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  25.66 
 
 		 378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0138  secretion protein HlyD family protein  27.64 
 
 		 378 aa  114  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03452  hypothetical protein  27.01 
 
 		 378 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0109  secretion protein HlyD family protein  27.01 
 
 		 378 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4967  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  27.01 
 
 		 378 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3930  auxiliary membrane fusion protein family transporter  27.01 
 
 		 378 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.954749 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03403  hypothetical protein  27.01 
 
 		 378 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3803  membrane fusion protein family protein  27.01 
 
 		 378 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.456542  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0434  secretion protein HlyD family protein  30.09 
 
 		 337 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.532566  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4095  membrane fusion protein family protein  27.01 
 
 		 378 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.557527  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0257  secretion protein, HlyD family  30.09 
 
 		 337 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.787376  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  31.31 
 
 		 352 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0470  secretion protein HlyD family protein  25.69 
 
 		 379 aa  112  8.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4014  auxiliary transport protein, membrane fusion protein family  26.72 
 
 		 378 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4857  RND family efflux transporter MFP subunit  32.98 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0115  secretion protein HlyD family protein  26.72 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0435233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2823  hypothetical protein  31.9 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33220  hypothetical protein  32.97 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0256894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  28.99 
 
 		 387 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  28.99 
 
 		 387 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0088  hypothetical protein  26.95 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000928582  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  30.42 
 
 		 365 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001143  fusaric acid resistance protein fusE  30.69 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3693  secretion protein HlyD family protein  25.51 
 
 		 378 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  30.58 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4546  multidrug resistance protein MdtN  29.24 
 
 		 343 aa  106  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3899  secretion protein HlyD family protein  26.88 
 
 		 378 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5590  multidrug resistance protein MdtN  28.9 
 
 		 343 aa  105  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000902  multidrug resistance efflux pump  30.26 
 
 		 311 aa  105  8e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  26.21 
 
 		 372 aa  105  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  32.01 
 
 		 380 aa  105  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03954  predicted membrane fusion protein of efflux pump  28.9 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3910  efflux pump membrane protein  28.9 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3945  multidrug resistance protein MdtN  28.9 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  25.9 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3016  secretion protein HlyD family protein  24.78 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03914  hypothetical protein  28.9 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3603  HlyD family secretion protein  25.5 
 
 		 378 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  27.19 
 
 		 368 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  26.86 
 
 		 402 aa  104  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  25.83 
 
 		 331 aa  104  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  27.63 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>