More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0287 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0287  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  460  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1053  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05152  protein-glutamate methylesterase  48.4 
 
 		 222 aa  209  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001275  transcriptional regulator VpsT  46.58 
 
 		 222 aa  196  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2858  probable CsgAB operon transcriptional regulatory protein  44.72 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.256874  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06533  hypothetical protein  35.1 
 
 		 217 aa  125  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05153  hypothetical protein  32.7 
 
 		 218 aa  123  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001276  transcriptional regulator VpsT  32.57 
 
 		 210 aa  122  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1253  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  44.78 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.705931 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1208  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  44.78 
 
 		 216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.316434  normal  0.419874 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3306  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1238  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  44.78 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2048  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  44.78 
 
 		 216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0804096  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2231  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  44.78 
 
 		 216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.750523  normal  0.99411 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1419  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  44.78 
 
 		 216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.132272 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1159  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  44.78 
 
 		 216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2093  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  44.78 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1158  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  44.78 
 
 		 216 aa  115  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.354651  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2559  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  44.78 
 
 		 216 aa  115  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.980478  normal  0.382247 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2605  transcriptional regulator, LuxR family  44.78 
 
 		 216 aa  115  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.196673  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1556  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  43.28 
 
 		 216 aa  114  8.999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417219  normal  0.369793 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01037  DNA-binding transcriptional activator in two-component regulatory system  43.38 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01044  hypothetical protein  43.38 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0994  response regulator receiver domain-containing protein  32.84 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.16925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002362  DNA-binding HTH domain-containing protein  34.09 
 
 		 214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0501055  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03706  hypothetical protein  33.33 
 
 		 214 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1248  transcriptional regulator, LuxR family  35.59 
 
 		 232 aa  108  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2814  LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 		 214 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2905  transcriptional regulator, LuxR family  35.51 
 
 		 335 aa  102  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1817  LuxR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.596206  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2759  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 211 aa  95.1  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550861  normal  0.145492 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1446  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0398792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2316  LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2386  LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2509  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  89.7  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.592216  hitchhiker  0.00000482381 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2332  response regulator receiver protein  30.1 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3194  LuxR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 220 aa  88.2  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0232917  normal  0.227391 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2725  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2327  regulatory protein, LuxR  31.37 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01507  putative transcriptional regulator, LuxR family protein  33.57 
 
 		 159 aa  87.8  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.993499  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3945  LuxR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00801334  normal  0.811932 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2948  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 221 aa  88.2  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0633  LuxR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3333  response regulator receiver protein  30.06 
 
 		 196 aa  87  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1880  LuxR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3887  LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000207134 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1517  transcriptional regulator, LuxR family protein  32.84 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.776537  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1726  LuxR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 208 aa  85.5  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.474249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1832  LuxR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 211 aa  85.5  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2490  transcriptional regulator, LuxR family  27.59 
 
 		 211 aa  85.5  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1788  response regulator receiver protein  27.59 
 
 		 211 aa  85.5  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1796  response regulator receiver protein  27.59 
 
 		 211 aa  85.5  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0560  transcriptional regulator, LuxR family protein  36.64 
 
 		 222 aa  85.1  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2620  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 239 aa  85.1  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.649971  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0644  LuxR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0140532  unclonable  0.00000001613 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3096  regulatory protein, LuxR  38.26 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.735562  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3137  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0863  transcriptional regulator, LuxR family  34.75 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3414  LuxR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.295313  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0864  LuxR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0720  LuxR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0333677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3704  LuxR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0339608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0840  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3302  LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0875  LuxR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3500  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03493  hypothetical protein  30.99 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  57.14 
 
 		 889 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.08 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.92 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.92 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4260  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.71 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2525  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.09 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2717  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.53 
 
 		 223 aa  72  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2472  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.43 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113125  hitchhiker  0.00367669 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 216 aa  72  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.45 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  30.2 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.1 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1410  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.17 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.46664  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  32.41 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.46 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.36 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  52.73 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  55.17 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.12 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1618  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.05 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4433  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.3 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03364  hypothetical protein  29.68 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0239  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.02 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  32.43 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.63 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5262  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.92 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.84 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 292 aa  67  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.98 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>