More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1483 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 456 aa  897    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  47.45 
 
 		 458 aa  426  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  47.22 
 
 		 487 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  47.76 
 
 		 487 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  47.09 
 
 		 485 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  47.76 
 
 		 487 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  47.56 
 
 		 485 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  47.53 
 
 		 487 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  46.99 
 
 		 485 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  35.45 
 
 		 477 aa  286  7e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  36.7 
 
 		 492 aa  280  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  36.74 
 
 		 488 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  36.8 
 
 		 475 aa  276  7e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  36.74 
 
 		 487 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  36.58 
 
 		 475 aa  274  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  33.84 
 
 		 479 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  33.84 
 
 		 479 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  36.15 
 
 		 472 aa  270  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  35.87 
 
 		 472 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  35.5 
 
 		 472 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  35.5 
 
 		 472 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  35.5 
 
 		 472 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  35.79 
 
 		 464 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0881  major facilitator superfamily MFS_1  36.38 
 
 		 448 aa  264  2e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  36.09 
 
 		 471 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  37.89 
 
 		 494 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  36.5 
 
 		 471 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  34.73 
 
 		 472 aa  264  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  34.5 
 
 		 479 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  36.17 
 
 		 472 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 479 aa  260  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  35.57 
 
 		 472 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  35.57 
 
 		 472 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  35.57 
 
 		 472 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  35.57 
 
 		 472 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  35.36 
 
 		 472 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  33.19 
 
 		 472 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  33.9 
 
 		 472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0463  major facilitator transporter  35.36 
 
 		 448 aa  253  4.0000000000000004e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0213055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  32.83 
 
 		 477 aa  249  6e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 472 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  36.95 
 
 		 469 aa  248  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 487 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  32.12 
 
 		 487 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 466 aa  231  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  32.17 
 
 		 482 aa  230  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 479 aa  230  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0667  major facilitator family transporter  36.62 
 
 		 494 aa  229  7e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482021  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  33.62 
 
 		 465 aa  228  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  36.38 
 
 		 474 aa  219  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  32.4 
 
 		 488 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  34.37 
 
 		 466 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00188  MFS transporter  33.41 
 
 		 471 aa  206  8e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103216  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 467 aa  200  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 462 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 		 459 aa  196  6e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 462 aa  196  9e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  28.79 
 
 		 461 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2576  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 475 aa  189  5.999999999999999e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.634768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 		 451 aa  189  8e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0443  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 461 aa  189  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 460 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  27.09 
 
 		 459 aa  188  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.29 
 
 		 450 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  32.46 
 
 		 470 aa  186  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 		 461 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 459 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1898  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 448 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 430 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 		 462 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.99 
 
 		 462 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.67 
 
 		 474 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 		 456 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 447 aa  176  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0909  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 455 aa  176  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0703326  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 468 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 463 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 473 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.57 
 
 		 462 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  28.93 
 
 		 460 aa  174  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 438 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  27.37 
 
 		 470 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 		 451 aa  172  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1718  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 473 aa  170  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  30.19 
 
 		 455 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 473 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.48 
 
 		 468 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 474 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 474 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 		 451 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.49 
 
 		 472 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 474 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  30.13 
 
 		 455 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 		 459 aa  162  9e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1857  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 459 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.526363  hitchhiker  0.0000247936 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1999  major facilitator family transporter  28.85 
 
 		 459 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0702699  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.44 
 
 		 468 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 463 aa  162  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  33.72 
 
 		 435 aa  162  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 473 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>