More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12461 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12461  transmembrane protein  100 
 
 
481 aa  966    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0226  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  41.31 
 
 
473 aa  326  6e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.512445  normal  0.203081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  29.15 
 
 
479 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2712  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  23.08 
 
 
507 aa  120  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0470198  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1178  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.74 
 
 
505 aa  114  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.811879  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2775  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  28.21 
 
 
493 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1534  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.51 
 
 
501 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231252  normal  0.283254 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6888  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25.77 
 
 
506 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2519  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  27.18 
 
 
492 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.806579  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7035  MscS mechanosensitive ion channel  35.48 
 
 
493 aa  97.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.666416  normal  0.218312 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2440  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25.93 
 
 
509 aa  96.7  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00769093 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1460  MscS mechanosensitive ion channel  34.84 
 
 
493 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6368  MscS mechanosensitive ion channel  34.84 
 
 
493 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2790  MscS mechanosensitive ion channel  38.1 
 
 
335 aa  89  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.557915 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1968  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25.14 
 
 
475 aa  89  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.805203  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5256  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  24.64 
 
 
475 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.584441  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5166  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25 
 
 
475 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0740457  normal  0.0860349 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1867  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  21.28 
 
 
480 aa  87  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0456814  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6691  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  22.96 
 
 
485 aa  87  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5308  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  23.92 
 
 
508 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.119708 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6131  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25.47 
 
 
489 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5823  MscS mechanosensitive ion channel  28.3 
 
 
345 aa  83.6  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  0.440829 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2122  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25 
 
 
489 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.510942  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4726  MscS mechanosensitive ion channel  30.63 
 
 
325 aa  79  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440183  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2387  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  24.94 
 
 
490 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178532  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3626  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.3 
 
 
489 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  34.35 
 
 
294 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  29.44 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243267  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  28.17 
 
 
281 aa  73.9  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  27.4 
 
 
400 aa  73.6  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0258  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25.93 
 
 
492 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 
345 aa  71.2  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  33.86 
 
 
825 aa  70.1  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  31.54 
 
 
859 aa  69.7  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  29.95 
 
 
288 aa  69.3  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  28.78 
 
 
262 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1153  MscS Mechanosensitive ion channel  30.95 
 
 
352 aa  68.9  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  27.57 
 
 
845 aa  68.6  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2162  periplasmic binding protein; mechanosensitive ion channel component  26.71 
 
 
794 aa  68.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  26.85 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  29.32 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0039  hypothetical protein  26.26 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4255  mechanosensitive (MS) ion channel protein  27.81 
 
 
311 aa  67  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  25.97 
 
 
361 aa  67  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4144  MscS mechanosensitive ion channel  27.81 
 
 
311 aa  67  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.789982 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  35.54 
 
 
825 aa  66.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1853  MscS mechanosensitive ion channel  25.91 
 
 
290 aa  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  31.73 
 
 
406 aa  66.2  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  27.95 
 
 
282 aa  66.6  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  30 
 
 
408 aa  66.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  25.33 
 
 
283 aa  65.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  32.31 
 
 
484 aa  65.5  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6057  MscS Mechanosensitive ion channel  29.24 
 
 
779 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 
287 aa  64.7  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 
304 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0546  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 
291 aa  64.3  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  27.38 
 
 
298 aa  64.3  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  27.24 
 
 
832 aa  64.3  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  32.81 
 
 
298 aa  64.3  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 
830 aa  64.3  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4274  hypothetical protein  28.68 
 
 
368 aa  63.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2569  MscS Mechanosensitive ion channel  30.09 
 
 
321 aa  63.9  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  23.7 
 
 
279 aa  63.9  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2357  hypothetical protein  25.66 
 
 
348 aa  63.5  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.116724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  28.38 
 
 
360 aa  63.5  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1106  small-conductance mechanosensitive channel  28.57 
 
 
265 aa  63.5  0.000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1154  hypothetical protein  31.39 
 
 
363 aa  63.5  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0298455  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  28.33 
 
 
806 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  30 
 
 
389 aa  62.4  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  27.27 
 
 
366 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2568  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 
358 aa  62  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2109  MscS Mechanosensitive ion channel  34.41 
 
 
306 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0420  hypothetical protein  26.6 
 
 
293 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.387203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0409  hypothetical protein  26.6 
 
 
293 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0214224  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  28.48 
 
 
369 aa  62.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  31.65 
 
 
867 aa  61.6  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0767  small-conductance mechanosensitive ion channel  32.97 
 
 
401 aa  61.6  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.967765  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  27.85 
 
 
549 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  24.13 
 
 
362 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4903  MscS mechanosensitive ion channel  31.78 
 
 
327 aa  62  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  27.88 
 
 
840 aa  61.6  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  27.85 
 
 
549 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  27.85 
 
 
549 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0773  MscS mechanosensitive ion channel  31.87 
 
 
401 aa  61.2  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03115  MscS Mechanosensitive ion channel  23.97 
 
 
378 aa  61.2  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  31.9 
 
 
294 aa  61.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  23.25 
 
 
338 aa  60.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  25.54 
 
 
393 aa  60.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19990  small-conductance mechanosensitive channel  27.5 
 
 
264 aa  60.5  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0579  MscS mechanosensitive ion channel  22.22 
 
 
440 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0872803  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  22.27 
 
 
359 aa  60.5  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  31.45 
 
 
482 aa  60.5  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  22.14 
 
 
633 aa  60.5  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1627  MscS mechanosensitive ion channel  26.63 
 
 
881 aa  60.5  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  25 
 
 
544 aa  60.5  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  23.61 
 
 
547 aa  60.1  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  27.42 
 
 
381 aa  60.1  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  28.17 
 
 
364 aa  60.1  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  31.45 
 
 
849 aa  60.1  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  21.75 
 
 
360 aa  60.1  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>