More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0276 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2068  soluble lytic transglycosylase  54.31 
 
 		 700 aa  667    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0276  soluble lytic transglycosylase  100 
 
 		 681 aa  1358    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24441  soluble lytic transglycosylase  46.24 
 
 		 677 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  32.02 
 
 		 690 aa  201  3.9999999999999996e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  25.83 
 
 		 720 aa  169  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  24.72 
 
 		 730 aa  157  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  31.87 
 
 		 735 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  24.56 
 
 		 730 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  25.7 
 
 		 729 aa  147  8.000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  23.77 
 
 		 724 aa  134  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  25.16 
 
 		 731 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  30.29 
 
 		 698 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  28.82 
 
 		 715 aa  115  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 		 719 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  30.47 
 
 		 721 aa  110  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  28.61 
 
 		 747 aa  105  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  38.85 
 
 		 643 aa  105  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  42.21 
 
 		 690 aa  104  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  39.07 
 
 		 748 aa  104  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0150  putative lytic transglycosylase catalytic  38.07 
 
 		 649 aa  103  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.862262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  38.46 
 
 		 654 aa  102  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  30.07 
 
 		 677 aa  102  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  31.06 
 
 		 661 aa  100  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  29.43 
 
 		 716 aa  100  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  25.08 
 
 		 709 aa  100  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03735  putative soluble lytic murein transglycosylase  36.77 
 
 		 576 aa  100  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  39.6 
 
 		 643 aa  99.4  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  39.74 
 
 		 756 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  26.69 
 
 		 709 aa  99.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  36.9 
 
 		 197 aa  99  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  37.09 
 
 		 798 aa  97.8  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  39.84 
 
 		 649 aa  97.8  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  38.26 
 
 		 660 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  39.86 
 
 		 673 aa  97.4  7e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  38.03 
 
 		 672 aa  97.4  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  28.69 
 
 		 637 aa  97.4  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  40.44 
 
 		 804 aa  97.1  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  38.26 
 
 		 657 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  31.05 
 
 		 788 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  38.26 
 
 		 649 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  31.25 
 
 		 679 aa  96.7  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0596592 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  38.26 
 
 		 641 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  37.84 
 
 		 649 aa  95.9  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  37.58 
 
 		 669 aa  95.9  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  37.84 
 
 		 649 aa  95.9  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  28.43 
 
 		 777 aa  95.5  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  36.18 
 
 		 603 aa  95.1  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  35.53 
 
 		 661 aa  95.5  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  34.42 
 
 		 664 aa  94.7  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  38.93 
 
 		 642 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  38.26 
 
 		 650 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  38.93 
 
 		 642 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0214  lytic transglycosylase, catalytic  41.86 
 
 		 374 aa  94.4  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  37.67 
 
 		 247 aa  94.4  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  42.98 
 
 		 207 aa  93.6  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  36.49 
 
 		 195 aa  93.6  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  41.79 
 
 		 206 aa  93.2  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  28.97 
 
 		 661 aa  93.2  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  37.58 
 
 		 642 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1431  soluble lytic transglycosylase  29.03 
 
 		 709 aa  92.8  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  35.62 
 
 		 639 aa  93.2  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  34.55 
 
 		 776 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  37.33 
 
 		 638 aa  92.8  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  35.62 
 
 		 639 aa  92.8  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  35.62 
 
 		 639 aa  93.2  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  34.55 
 
 		 774 aa  92  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  34.55 
 
 		 774 aa  92  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  36.31 
 
 		 686 aa  92  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  36.47 
 
 		 645 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1141  Lytic transglycosylase catalytic  29.57 
 
 		 691 aa  91.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  38.97 
 
 		 760 aa  92  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04268  lytic murein transglycosylase, soluble  36.47 
 
 		 645 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  36.47 
 
 		 645 aa  91.7  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  36.47 
 
 		 645 aa  91.7  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  38.26 
 
 		 642 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  36.47 
 
 		 645 aa  91.7  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0881  putative soluble lytic transglycosylase  36.69 
 
 		 653 aa  91.3  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  36.47 
 
 		 645 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  36.47 
 
 		 645 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  36.47 
 
 		 645 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  36.47 
 
 		 645 aa  91.7  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  40.15 
 
 		 757 aa  90.9  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0675  lytic murein transglycosylase  35.85 
 
 		 642 aa  91.3  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.586863 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2347  lytic transglycosylase, catalytic  36.6 
 
 		 640 aa  90.9  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0525  lytic murein transglycosylase  35.54 
 
 		 643 aa  91.3  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3087  lytic transglycosylase catalytic  38.93 
 
 		 726 aa  91.3  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 280 aa  90.9  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  37.58 
 
 		 642 aa  90.9  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0462  transglycosylase  29.32 
 
 		 654 aa  90.9  7e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.18202  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  27.22 
 
 		 650 aa  90.5  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2541  lytic transglycosylase, catalytic  36.69 
 
 		 677 aa  90.5  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00863759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0265  transglycosylase SLT domain protein  34.97 
 
 		 717 aa  90.9  8e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00304053  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  37.76 
 
 		 682 aa  90.1  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1930  lytic transglycosylase  36.42 
 
 		 735 aa  89.7  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0988  Lytic transglycosylase catalytic  28.96 
 
 		 691 aa  89.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.311649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  31.84 
 
 		 678 aa  90.1  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  35.33 
 
 		 650 aa  90.1  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  35.42 
 
 		 645 aa  89.4  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  41.48 
 
 		 217 aa  89.4  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1999  lytic transglycosylase, catalytic  27.65 
 
 		 628 aa  89.7  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>