113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1882 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1882  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 137 aa  283  5e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0571882 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2756  hypothetical protein  86.86 
 
 		 137 aa  251  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0928173 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1823  TetR family transcriptional regulator  76.69 
 
 		 137 aa  215  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000376424  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  37.31 
 
 		 222 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3866  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 230 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599707  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0354  hypothetical protein  42.31 
 
 		 230 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0313675 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 212 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0202  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 186 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 438 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 205 aa  47  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 211 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 237 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 227 aa  47  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 206 aa  46.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 180 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  37.7 
 
 		 258 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  38.98 
 
 		 221 aa  45.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 205 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3445  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 208 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  40 
 
 		 201 aa  45.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 205 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 203 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 217 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 205 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 211 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 205 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 199 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 239 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 205 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3234  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 191 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 236 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  37.5 
 
 		 209 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0045  transcriptional regulator  40.38 
 
 		 181 aa  44.7  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0375278  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 218 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37010  transcriptional regulator  45.83 
 
 		 195 aa  44.7  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 200 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 211 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 247 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 205 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 236 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 204 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 204 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 202 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 196 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4249  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.399807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 206 aa  42.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 220 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  35.09 
 
 		 224 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 242 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 400 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  32.89 
 
 		 190 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 218 aa  42  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 232 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  36.84 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 200 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0718  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 214 aa  41.6  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 234 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 208 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 234 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 223 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 197 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 208 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 197 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 197 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 194 aa  41.2  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5097  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 199 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  39.58 
 
 		 211 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  39.58 
 
 		 208 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 211 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 235 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 223 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3306  regulatory protein TetR  34.72 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000516611  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 218 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0005  TetR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 195 aa  40.8  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0931339  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1498  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 233 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0699971 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0855  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 244 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 201 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 191 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 239 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 204 aa  40.8  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 202 aa  40.4  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2087  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 206 aa  40.4  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0227018  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 201 aa  40.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  36.17 
 
 		 219 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 200 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 219 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 212 aa  40.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 203 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 213 aa  40.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  39.22 
 
 		 212 aa  40.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>