156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1583 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  100 
 
 		 225 aa  461  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  40.37 
 
 		 223 aa  176  4e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  40.17 
 
 		 221 aa  166  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0492  LmbE family protein  40 
 
 		 221 aa  166  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  37.9 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  38.33 
 
 		 225 aa  152  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  38.33 
 
 		 225 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  35.59 
 
 		 222 aa  135  5e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  33.19 
 
 		 227 aa  132  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  35.45 
 
 		 223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  34.07 
 
 		 227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1249  LmbE-like protein  33.64 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  33.64 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  33.48 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  32.16 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  32.44 
 
 		 230 aa  114  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  30.32 
 
 		 225 aa  111  9e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2248  hypothetical protein  33.03 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736622 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2173  LmbE family protein  29.2 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0611  LmbE family protein  31.51 
 
 		 569 aa  103  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  27.66 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0835  LmbE family protein  26.18 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.335446  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  28.57 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  28.5 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  29.11 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  27.65 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  26.67 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5396  LmbE family protein  29.24 
 
 		 237 aa  72  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.910627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0338  response regulator receiver protein  29.12 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35024  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  29.76 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  28.72 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  26.99 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  28.26 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  28.72 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  28.72 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  28.72 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  28.72 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  28.72 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  31.13 
 
 		 265 aa  67  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  28.49 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  28.19 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  25.11 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  25.34 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  26.11 
 
 		 359 aa  65.9  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1043  LmbE family protein  26.24 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3730  LmbE family protein  26.79 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  28.72 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  28.5 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  28.38 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  27 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1041  hypothetical protein  26.75 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  27.47 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  25.97 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  24.38 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  27.93 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  30.41 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  24.67 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  24.37 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  26.8 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  26.8 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  28.26 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  26.43 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  25.33 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0783  LmbE family protein  28.57 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.227533 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2252  hypothetical protein  26.96 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.960737  hitchhiker  0.007979 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  26.07 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0440  hypothetical protein  24.45 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.584207  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0383  hypothetical protein  24.45 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  26.09 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  25.62 
 
 		 276 aa  54.7  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  27.31 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  29.83 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  28.47 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  24.82 
 
 		 264 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  26.9 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  28.12 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  24.74 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  25.65 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  25.65 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  25.65 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  24.28 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3950  LmbE-like protein  26.34 
 
 		 217 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.591961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  27.04 
 
 		 223 aa  52.8  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  26.83 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  25.23 
 
 		 237 aa  52.4  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  29.67 
 
 		 237 aa  52  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  21.96 
 
 		 217 aa  51.6  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  24.38 
 
 		 270 aa  51.6  0.000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  30.71 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  25.34 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0312  LmbE family protein  24.63 
 
 		 487 aa  51.2  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  25 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  24.72 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3392  LmbE family protein  22.07 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  26.17 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  28.84 
 
 		 292 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  24.48 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  27.45 
 
 		 239 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  24.82 
 
 		 447 aa  48.5  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4099  LmbE-like protein  25.25 
 
 		 246 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.149754  normal  0.14336 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>