More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2171 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2171  deacetylase family protein  100 
 
 		 252 aa  519  1e-146  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00147256  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0994  histone deacetylase superfamily  46.44 
 
 		 271 aa  248  7e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.815956  normal  0.564868 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2577  histone deacetylase superfamily protein  44.18 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000513605  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0405  histone deacetylase superfamily protein  40.08 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1000  histone deacetylase superfamily protein  38.62 
 
 		 252 aa  148  8e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  33.46 
 
 		 365 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  32.43 
 
 		 307 aa  108  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  35.21 
 
 		 306 aa  105  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  31.43 
 
 		 341 aa  102  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  30.42 
 
 		 316 aa  102  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  31.9 
 
 		 341 aa  101  9e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  29.17 
 
 		 380 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00186  Histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  35.19 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0801  deacetylase / acetylpolyamine aminohydrolase  31.62 
 
 		 379 aa  99  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2459  histone deacetylase superfamily protein  31.25 
 
 		 379 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1220  histone deacetylase superfamily protein  34.42 
 
 		 317 aa  98.2  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.354736  normal  0.0941624 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  28.82 
 
 		 380 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1655  histone deacetylase family protein  32.75 
 
 		 317 aa  97.4  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2164  histone deacetylase superfamily protein  36.16 
 
 		 318 aa  97.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  29.54 
 
 		 307 aa  97.4  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  31.43 
 
 		 341 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0860  histone deacetylase superfamily  32.21 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0416  histone deacetylase family protein  30.71 
 
 		 307 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0213  histone deacetylase family protein  30.71 
 
 		 307 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2982  histone deacetylase family protein  30.71 
 
 		 307 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0936  histone deacetylase family protein  30.71 
 
 		 307 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2872  histone deacetylase family protein  30.71 
 
 		 307 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190592  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2560  histone deacetylase family protein  30.71 
 
 		 307 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2934  histone deacetylase family protein  30.71 
 
 		 307 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.664786  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0952  histone deacetylase superfamily protein  32.63 
 
 		 307 aa  97.1  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0823921  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  31.89 
 
 		 309 aa  96.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1648  histone deacetylase family protein  30.71 
 
 		 307 aa  96.3  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.406778  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  30.24 
 
 		 307 aa  96.3  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  30.25 
 
 		 344 aa  95.9  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  31.25 
 
 		 369 aa  95.1  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0919  hypothetical protein  33.33 
 
 		 307 aa  94.7  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.457278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0789  histone deacetylase superfamily  32.58 
 
 		 307 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  30.88 
 
 		 369 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  30.59 
 
 		 352 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  30.88 
 
 		 369 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  30.8 
 
 		 369 aa  93.2  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0594  histone deacetylase superfamily protein  41.1 
 
 		 330 aa  93.6  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  29.28 
 
 		 369 aa  93.2  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0992  putative histone deacetylase-family protein  30.37 
 
 		 334 aa  92.8  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  29.92 
 
 		 309 aa  92  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2991  histone deacetylase superfamily  29.26 
 
 		 307 aa  92  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  hitchhiker  0.00123553 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0844  histone deacetylase superfamily protein  36.27 
 
 		 310 aa  92  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729183  normal  0.248645 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  28.94 
 
 		 369 aa  92  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3319  histone deacetylase superfamily protein  31.44 
 
 		 306 aa  92  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  29.79 
 
 		 364 aa  91.7  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  31.18 
 
 		 309 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  32.24 
 
 		 328 aa  91.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  33.5 
 
 		 345 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  24.67 
 
 		 344 aa  91.7  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  31.33 
 
 		 307 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2697  histone deacetylase superfamily protein  32.16 
 
 		 307 aa  90.5  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458585  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0733  histone deacetylase superfamily protein  36.02 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.780439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0335  histone deacetylase superfamily protein  31.63 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  28.57 
 
 		 309 aa  90.1  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2528  histone deacetylase superfamily protein  34.24 
 
 		 315 aa  90.1  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3145  histone deacetylase superfamily protein  34.41 
 
 		 317 aa  90.1  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0463  histone deacetylase superfamily protein  31.08 
 
 		 284 aa  90.1  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.157576  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2302  histone deacetylase superfamily  35.96 
 
 		 319 aa  89.7  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2813  histone deacetylase superfamily protein  35.43 
 
 		 319 aa  89.4  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.573371  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  33.18 
 
 		 308 aa  89.4  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  30.56 
 
 		 313 aa  89.4  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2503  histone deacetylase superfamily protein  33.82 
 
 		 308 aa  88.6  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  28.87 
 
 		 309 aa  88.6  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1016  histone deacetylase superfamily protein  31.72 
 
 		 307 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  31.33 
 
 		 324 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0855  histone deacetylase superfamily protein  29.96 
 
 		 306 aa  87.8  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  30.31 
 
 		 309 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0578  histone deacetylase superfamily protein  31.72 
 
 		 307 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522993  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1057  histone deacetylase superfamily protein  31.72 
 
 		 307 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  28.62 
 
 		 331 aa  87.8  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0057  histone deacetylase superfamily protein  31.78 
 
 		 308 aa  87.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.620754  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3376  Histone deacetylase  33.87 
 
 		 317 aa  87.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2095  histone deacetylase superfamily protein  35.26 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2247  histone deacetylase superfamily protein  31.34 
 
 		 307 aa  87  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  30.31 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1360  Histone deacetylase  30 
 
 		 307 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4170  histone deacetylase superfamily protein  31.34 
 
 		 307 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0937  histone deacetylase superfamily protein  31.72 
 
 		 307 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0933  histone deacetylase superfamily protein  31.72 
 
 		 307 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2236  histone deacetylase superfamily protein  31.79 
 
 		 322 aa  85.9  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0756  histone deacetylase superfamily protein  31.52 
 
 		 307 aa  86.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2555  histone deacetylase superfamily protein  36.56 
 
 		 307 aa  85.9  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  31.31 
 
 		 314 aa  85.9  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  33.02 
 
 		 314 aa  85.5  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  26.54 
 
 		 370 aa  85.5  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  27 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2387  histone deacetylase superfamily protein  32 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  31.34 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00780  histone deacetylase clr3, putative  28.88 
 
 		 737 aa  84.3  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568291  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  31.13 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0860  histone deacetylase superfamily protein  31.6 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1246  putative histone deacetylase-family protein  36 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0489566  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1905  histone deacetylase superfamily protein  26.62 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  30.52 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  26.83 
 
 		 370 aa  82.8  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>