More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0844 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0844  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 310 aa  620  1e-177  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729183  normal  0.248645 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  51.28 
 
 		 313 aa  281  7.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  44.79 
 
 		 337 aa  245  6.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  44.79 
 
 		 316 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  45.72 
 
 		 307 aa  243  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  45.11 
 
 		 316 aa  242  5e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  47.6 
 
 		 307 aa  242  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  48.29 
 
 		 324 aa  242  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  47.95 
 
 		 307 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0335  histone deacetylase superfamily protein  44.98 
 
 		 307 aa  240  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  45.02 
 
 		 308 aa  238  8e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  48.54 
 
 		 310 aa  237  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  44.01 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  42.9 
 
 		 314 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  44.23 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  43.79 
 
 		 309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  45.08 
 
 		 309 aa  233  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1360  Histone deacetylase  46.13 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  43.55 
 
 		 314 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  40.85 
 
 		 311 aa  229  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  44.48 
 
 		 315 aa  229  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  41.75 
 
 		 309 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  41.75 
 
 		 309 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  42.53 
 
 		 348 aa  229  6e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  42.07 
 
 		 309 aa  228  9e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  42.26 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0397  histone deacetylase superfamily protein  45.4 
 
 		 319 aa  226  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  40.52 
 
 		 311 aa  225  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0860  histone deacetylase superfamily  43.59 
 
 		 307 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  40.45 
 
 		 309 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  41.99 
 
 		 328 aa  223  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  42.63 
 
 		 325 aa  223  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  42.31 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  43.69 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  40.71 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0213  histone deacetylase family protein  42.77 
 
 		 307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  40.19 
 
 		 311 aa  221  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0416  histone deacetylase family protein  42.77 
 
 		 307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  41.42 
 
 		 309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2982  histone deacetylase family protein  42.77 
 
 		 307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2872  histone deacetylase family protein  42.77 
 
 		 307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2934  histone deacetylase family protein  42.77 
 
 		 307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.664786  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  42.33 
 
 		 308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0789  histone deacetylase superfamily  42.95 
 
 		 307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2560  histone deacetylase family protein  42.77 
 
 		 307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0936  histone deacetylase family protein  42.77 
 
 		 307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1648  histone deacetylase family protein  42.44 
 
 		 307 aa  219  6e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.406778  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2991  histone deacetylase superfamily  43.91 
 
 		 307 aa  219  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  hitchhiker  0.00123553 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1220  histone deacetylase superfamily protein  39.88 
 
 		 317 aa  218  8.999999999999998e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.354736  normal  0.0941624 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  42.49 
 
 		 323 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  40.13 
 
 		 309 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  42.66 
 
 		 326 aa  215  8e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0919  hypothetical protein  42.86 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.457278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3319  histone deacetylase superfamily protein  48.29 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04641  acetoin utilization family protein  47.37 
 
 		 302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103807  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0933  histone deacetylase superfamily protein  41.8 
 
 		 307 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0937  histone deacetylase superfamily protein  41.8 
 
 		 307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4170  histone deacetylase superfamily protein  42.12 
 
 		 307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0952  histone deacetylase superfamily protein  39.81 
 
 		 307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0823921  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3376  Histone deacetylase  42.59 
 
 		 317 aa  212  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3064  histone deacetylase superfamily  42.58 
 
 		 308 aa  211  9e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2247  histone deacetylase superfamily protein  43.13 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  43.31 
 
 		 347 aa  211  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  40.38 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1200  histone deacetylase superfamily protein  45.05 
 
 		 309 aa  210  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3145  histone deacetylase superfamily protein  41.43 
 
 		 317 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0992  putative histone deacetylase-family protein  42.44 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0578  histone deacetylase superfamily protein  41.8 
 
 		 307 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522993  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1057  histone deacetylase superfamily protein  41.8 
 
 		 307 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0756  histone deacetylase superfamily protein  42.77 
 
 		 307 aa  209  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  40.4 
 
 		 321 aa  209  7e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0733  histone deacetylase superfamily protein  42.81 
 
 		 307 aa  209  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.780439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1016  histone deacetylase superfamily protein  41.48 
 
 		 307 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2528  histone deacetylase superfamily protein  40.82 
 
 		 315 aa  206  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1905  histone deacetylase superfamily protein  41.8 
 
 		 312 aa  206  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  42.12 
 
 		 309 aa  206  6e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1476  histone deacetylase superfamily protein  38.91 
 
 		 307 aa  205  8e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.436214  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4185  histone deacetylase superfamily protein  41.22 
 
 		 308 aa  202  8e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1246  putative histone deacetylase-family protein  42.31 
 
 		 313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0489566  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  38.23 
 
 		 307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  39.48 
 
 		 309 aa  199  5e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1749  histone deacetylase superfamily protein  39.03 
 
 		 305 aa  199  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0534  histone deacetylase  39.66 
 
 		 304 aa  198  7.999999999999999e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2555  histone deacetylase superfamily protein  43.91 
 
 		 307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0772  histone deacetylase superfamily  40.84 
 
 		 306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  40.18 
 
 		 344 aa  197  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2911  histone deacetylase superfamily protein  39.68 
 
 		 311 aa  196  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.363105 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  39.53 
 
 		 306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2164  histone deacetylase superfamily protein  42.3 
 
 		 318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00186  Histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  37.96 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0855  histone deacetylase superfamily protein  37.99 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  41.58 
 
 		 352 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0672  histone deacetylase superfamily  45.78 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0541472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4443  histone deacetylase superfamily protein  40.82 
 
 		 306 aa  193  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2025  histone deacetylase family protein  41.16 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2095  histone deacetylase superfamily protein  40.51 
 
 		 317 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1514  putative histone deacetylase-family protein  40.74 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14124  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  39.61 
 
 		 343 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1863  Histone deacetylase  39.73 
 
 		 310 aa  189  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  39.02 
 
 		 341 aa  189  5e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>