More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_36850 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_36850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  100 
 
 		 836 aa  1619    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0559  transcriptional regulator, LuxR family  45.72 
 
 		 788 aa  484  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0620  response regulator receiver protein  35.82 
 
 		 843 aa  303  7.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0430  LuxR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 845 aa  296  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.32699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10344  transcriptional regulator  37.68 
 
 		 832 aa  291  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3086  transcriptional regulator, LuxR family  35.97 
 
 		 695 aa  283  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0443  LuxR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 845 aa  282  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0453  LuxR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 845 aa  282  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00902802  normal  0.164527 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0277  response regulator receiver protein  34.56 
 
 		 833 aa  266  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1635  LuxR family transcriptional regulator  41 
 
 		 818 aa  191  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1650  regulatory protein, LuxR  40.44 
 
 		 794 aa  188  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315022  normal  0.343942 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4437  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 218 aa  62  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.784745  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  51.52 
 
 		 956 aa  60.1  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  41.05 
 
 		 824 aa  58.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  48.39 
 
 		 799 aa  58.2  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  41.56 
 
 		 923 aa  57.8  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 959 aa  57.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0613  nitrate/nitrite response regulator NarP  38.3 
 
 		 208 aa  57  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  39.68 
 
 		 993 aa  57  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  50 
 
 		 907 aa  57  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 910 aa  56.6  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3178  transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 1074 aa  56.2  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00421599  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 215 aa  55.8  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 1030 aa  55.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  42.35 
 
 		 982 aa  55.1  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  53.06 
 
 		 998 aa  54.7  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 258 aa  54.7  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  34.02 
 
 		 977 aa  54.7  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  51.72 
 
 		 765 aa  54.7  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  58.7 
 
 		 973 aa  54.3  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 889 aa  53.9  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  50 
 
 		 963 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 218 aa  53.9  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 213 aa  53.9  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  50 
 
 		 567 aa  53.9  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  49.02 
 
 		 574 aa  53.9  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3795  ATPase-like protein  49.15 
 
 		 925 aa  54.3  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.978971  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02316  transcription regulator protein  44.26 
 
 		 227 aa  53.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.499262 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  41.25 
 
 		 212 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1403  hypothetical protein  33.87 
 
 		 252 aa  53.5  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  37.35 
 
 		 202 aa  53.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  41.25 
 
 		 212 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5633  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 203 aa  53.5  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.603295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  40.51 
 
 		 967 aa  53.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 231 aa  52.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  28.66 
 
 		 995 aa  53.5  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  41.25 
 
 		 212 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  41.25 
 
 		 212 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  41.25 
 
 		 212 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  41.25 
 
 		 212 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  41.25 
 
 		 212 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3505  LuxR family two component transcriptional regulator  46 
 
 		 213 aa  52.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.345096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  37.5 
 
 		 929 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  50.98 
 
 		 937 aa  52  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3551  cyclic nucleotide-binding protein  41.94 
 
 		 1001 aa  52.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 556 aa  52.4  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 214 aa  52  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  39.73 
 
 		 867 aa  52  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  44.44 
 
 		 855 aa  52.4  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  39.66 
 
 		 550 aa  52.4  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 204 aa  52  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3097  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.16 
 
 		 222 aa  52  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472018  normal  0.507317 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0518  two component LuxR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 225 aa  52  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  37.08 
 
 		 916 aa  52  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  40.26 
 
 		 930 aa  52  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  51.6  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  51.6  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  51.6  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 956 aa  51.6  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  42.68 
 
 		 925 aa  51.6  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  37.08 
 
 		 964 aa  51.6  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  51.6  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3551  transcriptional regulator, LuxR family  42.03 
 
 		 893 aa  51.6  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  51.6  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0097  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.16 
 
 		 209 aa  51.6  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142871  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1719  response regulator receiver  48.08 
 
 		 231 aa  51.6  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760885  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  51.6  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  51.6  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 207 aa  51.6  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1495  two component transcriptional regulator, LuxR family  46 
 
 		 207 aa  51.6  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194449  normal  0.395611 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  40 
 
 		 212 aa  51.6  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 970 aa  51.6  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1181  response regulator, positive activator of uhpT transcription  30.43 
 
 		 318 aa  51.6  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041551  decreased coverage  0.008996 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0642  putative response regulator  41.54 
 
 		 217 aa  51.2  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0244  response regulator receiver protein  45.61 
 
 		 868 aa  51.2  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140274 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1021  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 216 aa  51.2  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.794365 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0068  regulatory protein LuxR  44.64 
 
 		 867 aa  51.2  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289946  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.57 
 
 		 889 aa  51.2  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 214 aa  51.2  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 214 aa  51.2  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  33.82 
 
 		 217 aa  51.2  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2415  two component LuxR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 217 aa  51.2  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0163  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.65 
 
 		 213 aa  51.2  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.107009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3606  regulatory protein, LuxR  45.1 
 
 		 229 aa  51.2  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.527821  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1734  two component transcriptional regulator, LuxR family  48 
 
 		 188 aa  51.2  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2254  LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 224 aa  51.2  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000750634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.26 
 
 		 212 aa  50.8  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02400  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.79 
 
 		 255 aa  50.8  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>