More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3037 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  100 
 
 		 360 aa  728    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  81.51 
 
 		 358 aa  531  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  55.8 
 
 		 359 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  55.81 
 
 		 372 aa  375  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  48.43 
 
 		 347 aa  311  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  55.46 
 
 		 443 aa  263  3e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2948  chitin-binding domain 3 protein  60.77 
 
 		 306 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0411375  hitchhiker  0.000170836 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  41.01 
 
 		 354 aa  236  6e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4563  chitin-binding domain 3 protein  58.29 
 
 		 212 aa  203  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  49.09 
 
 		 438 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  45 
 
 		 307 aa  188  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  35.81 
 
 		 389 aa  185  9e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  50.5 
 
 		 429 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  40.25 
 
 		 400 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  40.78 
 
 		 378 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  35.42 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  39.51 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  39.02 
 
 		 388 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  39.91 
 
 		 285 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  37.45 
 
 		 391 aa  132  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  47.79 
 
 		 474 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  32.95 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  48.6 
 
 		 847 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  33.33 
 
 		 392 aa  103  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  28.33 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  50.55 
 
 		 448 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0217  chitinase B  30.42 
 
 		 395 aa  100  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  33.63 
 
 		 201 aa  99.8  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  50 
 
 		 456 aa  98.2  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  51.02 
 
 		 422 aa  97.4  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  32.63 
 
 		 402 aa  97.4  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  50 
 
 		 460 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  46.88 
 
 		 913 aa  93.2  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  47.06 
 
 		 460 aa  92.8  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  49.49 
 
 		 353 aa  92.8  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  51.96 
 
 		 978 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3518  chitin-binding domain 3 protein  32 
 
 		 235 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02190  hypothetical protein  32.16 
 
 		 497 aa  90.5  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2244  chitin-binding domain 3 protein  29.36 
 
 		 351 aa  89.7  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.620526  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  44.55 
 
 		 477 aa  89.7  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  50.53 
 
 		 593 aa  89.4  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0759  chitin binding domain-containing protein  34.11 
 
 		 408 aa  89.4  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0669  chitin-binding protein  34.11 
 
 		 408 aa  89.4  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1785  chitin binding domain-containing protein  34.11 
 
 		 365 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361699  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  42.42 
 
 		 812 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  42.06 
 
 		 543 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0777  chitin-binding protein  34.11 
 
 		 365 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.875326  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1070  chitin-binding protein  34.11 
 
 		 378 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2045  chitin-binding protein  34.11 
 
 		 365 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.548348  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2047  chitin binding domain-containing protein  34.11 
 
 		 417 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  41.75 
 
 		 449 aa  86.7  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1268  putative secreted cellulose-binding protein  31.25 
 
 		 222 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.459217  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1925  chitin binding domain-containing protein  33.64 
 
 		 449 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  44.57 
 
 		 688 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  41.96 
 
 		 609 aa  84.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  37.93 
 
 		 437 aa  83.6  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  40.32 
 
 		 846 aa  82.8  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  42.86 
 
 		 763 aa  82.8  0.000000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  44.76 
 
 		 447 aa  82.4  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  42.86 
 
 		 678 aa  82  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  30.17 
 
 		 368 aa  82  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  44.57 
 
 		 842 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  41.58 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  48.19 
 
 		 925 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  42.86 
 
 		 656 aa  81.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  43.16 
 
 		 681 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  44.66 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  40.37 
 
 		 702 aa  80.5  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  44.21 
 
 		 494 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  41.3 
 
 		 518 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  44.68 
 
 		 489 aa  80.1  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  45.26 
 
 		 451 aa  80.1  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  41.84 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2475  chitin-binding domain 3 protein  29.96 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  36.84 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  47.87 
 
 		 973 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  46.39 
 
 		 423 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  45.92 
 
 		 499 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  41.18 
 
 		 673 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  39.36 
 
 		 906 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  40.82 
 
 		 1209 aa  79  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4693  chitin-binding domain 3 protein  28.51 
 
 		 220 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1219  cellulose-binding family II  43.14 
 
 		 911 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3305  chitin binding domain-containing protein  29.2 
 
 		 534 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000109771  hitchhiker  0.000135909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3293  chitin-binding domain-containing protein  29.2 
 
 		 534 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  41.35 
 
 		 469 aa  78.2  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3154  chitin binding domain-containing protein  29.2 
 
 		 534 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  40.74 
 
 		 854 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  47.25 
 
 		 658 aa  77  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  39.05 
 
 		 998 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  42.71 
 
 		 775 aa  76.6  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  45.26 
 
 		 436 aa  76.3  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  40.82 
 
 		 608 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2774  cellulose-binding family II  51.11 
 
 		 89 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.691497  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0633  hypothetical protein  34.12 
 
 		 436 aa  75.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.746615  normal  0.741737 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  37.29 
 
 		 486 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  30.81 
 
 		 201 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  43.43 
 
 		 474 aa  75.9  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1831  cellulose-binding family II  39.8 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  37.5 
 
 		 773 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>