250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0846 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 185 aa  356  9.999999999999999e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  84.32 
 
 		 185 aa  294  6e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 		 183 aa  91.7  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0115  regulatory protein, MarR  41.13 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0627652  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36750  transcriptional regulator  38.64 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49551  normal  0.235126 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  29.61 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4036  MarR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 154 aa  72  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  41.35 
 
 		 152 aa  70.5  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3830  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  29.49 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  34.19 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  32.41 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04490  MarR family regulator  33.04 
 
 		 180 aa  57  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  39.66 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  30.06 
 
 		 178 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 143 aa  54.3  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  33.91 
 
 		 161 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9046  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 139 aa  52.4  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5345  hypothetical protein  33.05 
 
 		 162 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 160 aa  52  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  22.45 
 
 		 153 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2662  transcriptional regulator, MarR family  36.47 
 
 		 152 aa  51.6  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800097  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 		 153 aa  51.2  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 160 aa  50.8  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10950  transcriptional regulator  28.86 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 		 153 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 151 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  33.81 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 151 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 151 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  26.81 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 148 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  36.28 
 
 		 287 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 165 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 172 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 172 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 172 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 172 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1826  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  49.7  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 139 aa  49.7  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  37.78 
 
 		 166 aa  49.3  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 172 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  32.31 
 
 		 147 aa  49.3  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 172 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 172 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 136 aa  49.3  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 148 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03440  transcriptional regulator, MarR family  38.3 
 
 		 169 aa  48.9  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.495444  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 167 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  24.24 
 
 		 167 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 164 aa  48.5  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3267  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 411 aa  48.1  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0199  transcriptional regulator, MarR family  55.56 
 
 		 165 aa  48.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 		 168 aa  47.8  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7355  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 148 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.238982 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 159 aa  47.8  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 		 148 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 159 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 		 183 aa  47.8  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 		 148 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 167 aa  47.8  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 148 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 148 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 148 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 148 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 148 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2807  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5532  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.008053  hitchhiker  0.0000039263 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3523  transcriptional regulator, TrmB  30.16 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15440  MarR family regulator  30.58 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00511304  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  35.96 
 
 		 154 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3813  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 200 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 137 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0285  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.742627  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  32.94 
 
 		 166 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>