258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4612 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  100 
 
 
416 aa  761    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  45.62 
 
 
482 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  38.32 
 
 
1107 aa  266  5e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  43.16 
 
 
1041 aa  244  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  39.95 
 
 
508 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  40.7 
 
 
1263 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  42.86 
 
 
867 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  41.09 
 
 
354 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  41.13 
 
 
863 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  42.22 
 
 
1015 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  44.92 
 
 
892 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  30.73 
 
 
713 aa  173  5e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  34.03 
 
 
757 aa  169  7e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  38.53 
 
 
937 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  38.53 
 
 
937 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  32.19 
 
 
1749 aa  164  4.0000000000000004e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  34.74 
 
 
1024 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  43.88 
 
 
886 aa  138  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  39.66 
 
 
242 aa  137  5e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  39.39 
 
 
307 aa  134  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  42.15 
 
 
448 aa  126  9e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  36.73 
 
 
296 aa  124  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  31.34 
 
 
2491 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  39.14 
 
 
1266 aa  120  3e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  29.33 
 
 
1344 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  42.06 
 
 
761 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  30.95 
 
 
559 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  34.3 
 
 
476 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  42.31 
 
 
447 aa  110  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  41.76 
 
 
447 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  41.57 
 
 
414 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  35.78 
 
 
446 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  39.78 
 
 
447 aa  104  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  40.45 
 
 
453 aa  103  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5260  leucine-rich repeat-containing protein  28.18 
 
 
558 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  36.32 
 
 
396 aa  103  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12927  predicted protein  34.02 
 
 
526 aa  102  9e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  38.1 
 
 
475 aa  101  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30.1 
 
 
472 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  40 
 
 
436 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  39.66 
 
 
436 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  35.29 
 
 
441 aa  100  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  28.91 
 
 
528 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  34.83 
 
 
440 aa  99.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  34.15 
 
 
421 aa  99.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  37.63 
 
 
413 aa  99.4  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  38.33 
 
 
484 aa  99.4  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  36.72 
 
 
451 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  35.47 
 
 
755 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  35.47 
 
 
755 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  37.13 
 
 
471 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  26.87 
 
 
2132 aa  97.8  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  39.78 
 
 
451 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  39.78 
 
 
444 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  36.72 
 
 
451 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  37.58 
 
 
788 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  37.58 
 
 
788 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  39.89 
 
 
451 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  38.12 
 
 
439 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  37.21 
 
 
444 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  35.47 
 
 
731 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_107  predicted protein  31.89 
 
 
601 aa  96.7  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.799153  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  36.91 
 
 
788 aa  96.3  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  30.71 
 
 
467 aa  94.7  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  44.6 
 
 
291 aa  95.1  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  38.2 
 
 
412 aa  94.4  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  39.67 
 
 
437 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  35.15 
 
 
460 aa  94  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  37.36 
 
 
440 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  37.21 
 
 
473 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  37.29 
 
 
438 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  35.64 
 
 
469 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  34.65 
 
 
437 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  37.57 
 
 
490 aa  92  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  32.84 
 
 
459 aa  90.9  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  36.11 
 
 
434 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  36.72 
 
 
445 aa  91.3  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  38.12 
 
 
437 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  34.94 
 
 
1744 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  37.64 
 
 
499 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  38.12 
 
 
437 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1389  predicted protein  35.05 
 
 
334 aa  90.5  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000000337906  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  36.44 
 
 
565 aa  90.5  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  38.67 
 
 
446 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_2593  predicted protein  33.9 
 
 
304 aa  89.7  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  37.23 
 
 
648 aa  89  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  34.65 
 
 
441 aa  89.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  35.52 
 
 
439 aa  89  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  36.8 
 
 
615 aa  88.6  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2739  predicted protein  41.71 
 
 
230 aa  87.8  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  30.17 
 
 
432 aa  87.4  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  34.29 
 
 
755 aa  87.4  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4625  leucine-rich repeat protein  28.65 
 
 
569 aa  86.7  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  33.85 
 
 
450 aa  86.3  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45913  predicted protein  32.87 
 
 
1012 aa  85.1  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0745  leucine-rich repeat-containing protein  35.82 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  33.16 
 
 
414 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  36.27 
 
 
464 aa  84.7  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  29.65 
 
 
802 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5261  leucine-rich repeat-containing protein  27.73 
 
 
558 aa  84  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>