More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3249 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3249  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2587  transcriptional regulator, GntR family  54.81 
 
 		 225 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3003  GntR family transcriptional regulator  55.87 
 
 		 216 aa  219  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.88449  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5794  GntR family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 216 aa  189  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.499675 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4416  GntR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5572  GntR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2118  GntR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 233 aa  157  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.654279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  41.55 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3658  GntR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0786  GntR family transcriptional regulator  44.13 
 
 		 253 aa  152  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000452632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8055  transcriptional regulator, GntR family  42.44 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3327  GntR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 250 aa  149  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2899  GntR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.527875  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1334  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 227 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.164472 
 
 
-
 
NC_004310  BR1795  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1728  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 231 aa  128  8.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.414703  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1109  GntR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3321  GntR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 230 aa  125  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.216307  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5216  transcriptional regulator, GntR family  34.15 
 
 		 234 aa  124  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293373  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0496  transcriptional regulator, GntR family  37.98 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.50739  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1712  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1896  transcriptional regulator, GntR family  33.83 
 
 		 204 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.280079  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0046  regulatory protein GntR, HTH  32.39 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3277  transcriptional regulator, GntR family  35.64 
 
 		 259 aa  118  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 225 aa  98.2  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 223 aa  98.2  8e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 216 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3906  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 244 aa  95.1  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 227 aa  95.1  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3706  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 223 aa  95.1  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 216 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 249 aa  92  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  29.13 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0982  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0526617 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 239 aa  89.4  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 230 aa  89.4  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0544  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 226 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1023  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 226 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0899  GntR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 226 aa  88.2  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.742389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5325  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 		 263 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3461  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 		 226 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  31.77 
 
 		 226 aa  87.4  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0887  GntR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 258 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3450  transcriptional regulator, GntR family  28.98 
 
 		 231 aa  86.7  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101357  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  30.86 
 
 		 226 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 255 aa  85.9  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.72 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  32.64 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  29.57 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  36.5 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0891  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.881973  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2372  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18860  transcriptional regulator, GntR family  27.5 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0812431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4135  GntR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7641  transcriptional regulator, GntR family  29.79 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.587839 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3363  transcriptional regulator, GntR family  31.32 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2915  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4198  GntR domain protein  30.32 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2831  transcriptional regulator, GntR family  27.96 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  28.18 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14130  transcriptional regulator, GntR family  34.97 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.377103  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 228 aa  74.7  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 274 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  27.72 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4801  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2126  transcriptional regulator, GntR family  31.69 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>