More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3411 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  46.38 
 
 		 1088 aa  775    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 953 aa  1956    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  37.32 
 
 		 935 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  34.15 
 
 		 935 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  33.91 
 
 		 930 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  34.15 
 
 		 935 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  33.91 
 
 		 930 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  33.67 
 
 		 930 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  34.15 
 
 		 935 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  33.81 
 
 		 936 aa  481  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  33.89 
 
 		 933 aa  475  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  33.4 
 
 		 937 aa  473  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  32.85 
 
 		 952 aa  459  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  32.05 
 
 		 987 aa  452  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  32.33 
 
 		 944 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  32.4 
 
 		 985 aa  446  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  34.1 
 
 		 981 aa  444  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  32.81 
 
 		 904 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  33.23 
 
 		 904 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  33.16 
 
 		 904 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 904 aa  438  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 981 aa  427  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  33.06 
 
 		 897 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 869 aa  391  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  33.02 
 
 		 901 aa  391  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  31.89 
 
 		 965 aa  391  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  31.9 
 
 		 907 aa  392  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  30.12 
 
 		 966 aa  384  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  31.21 
 
 		 974 aa  379  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 873 aa  375  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 975 aa  373  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 907 aa  372  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 		 873 aa  372  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 966 aa  355  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 843 aa  342  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  30.44 
 
 		 842 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  29.95 
 
 		 914 aa  340  7e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 912 aa  338  3.9999999999999995e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 924 aa  336  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 966 aa  334  4e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 855 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 910 aa  331  3e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 838 aa  331  4e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 841 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 855 aa  326  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 957 aa  326  1e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 951 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 		 853 aa  319  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 		 853 aa  318  3e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 		 853 aa  318  3e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 861 aa  312  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 861 aa  312  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 861 aa  313  1e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 836 aa  312  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  29.85 
 
 		 839 aa  311  4e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  29.59 
 
 		 853 aa  310  8e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 853 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 852 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 861 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 849 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 944 aa  304  6.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 861 aa  303  9e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 857 aa  303  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 861 aa  303  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 967 aa  301  4e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 855 aa  301  4e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  28.56 
 
 		 947 aa  297  5e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 935 aa  295  4e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 817 aa  286  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  31.45 
 
 		 709 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 1015 aa  284  6.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 938 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  29.44 
 
 		 929 aa  283  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 869 aa  281  3e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 847 aa  281  4e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 871 aa  281  6e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 966 aa  280  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 901 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 904 aa  275  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  29.84 
 
 		 877 aa  274  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 951 aa  274  7e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4293  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 		 973 aa  273  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  0.297709 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  28.86 
 
 		 880 aa  272  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 948 aa  271  4e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 946 aa  270  8e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 956 aa  265  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 1007 aa  266  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 1007 aa  265  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  28.1 
 
 		 1007 aa  263  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  27.21 
 
 		 834 aa  262  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 1009 aa  260  7e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 884 aa  260  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 976 aa  259  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 891 aa  258  4e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 969 aa  257  7e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 879 aa  256  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 874 aa  254  5.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 944 aa  254  5.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  26.15 
 
 		 827 aa  254  6e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 927 aa  254  7e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>