185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2537 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  100 
 
 
190 aa  379  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01075  TonB family C-terminal domain protein  38.24 
 
 
170 aa  103  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453283  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06244  TonB family C-terminal domain protein  38.24 
 
 
170 aa  103  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.484779  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  43.01 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  44.71 
 
 
221 aa  79  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  44.71 
 
 
221 aa  78.6  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  46.75 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  41.41 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  41.41 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  40.51 
 
 
349 aa  65.1  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0008  TonB family protein  46.75 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440942 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  40.5 
 
 
218 aa  64.3  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  39.51 
 
 
308 aa  62  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  42.55 
 
 
371 aa  61.2  0.000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  34.94 
 
 
203 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  34.94 
 
 
203 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  43.59 
 
 
371 aa  60.5  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  33.08 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  45.71 
 
 
271 aa  59.7  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  35.48 
 
 
244 aa  59.3  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  35.48 
 
 
244 aa  59.3  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  32.5 
 
 
249 aa  59.3  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  34.15 
 
 
203 aa  58.2  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  32.53 
 
 
203 aa  58.2  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  30 
 
 
207 aa  58.2  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  32.53 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  32.53 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  32.26 
 
 
203 aa  56.6  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  38.1 
 
 
212 aa  56.6  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  32.1 
 
 
112 aa  56.6  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0839  TonB family protein  34.57 
 
 
302 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0400765 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  32.43 
 
 
218 aa  56.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2277  TonB-like protein  40.79 
 
 
219 aa  56.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380607  normal  0.0262675 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0077  TonB-like protein  37.18 
 
 
150 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  35.71 
 
 
215 aa  55.5  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  37.4 
 
 
287 aa  55.5  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  40 
 
 
193 aa  54.3  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1002  TonB family protein  35.48 
 
 
260 aa  54.3  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000685032 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  39.02 
 
 
280 aa  54.3  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  37.5 
 
 
234 aa  53.9  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2295  TonB-like  40.58 
 
 
507 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459858  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  31.71 
 
 
206 aa  53.9  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  32.26 
 
 
203 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  41.03 
 
 
277 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  36.59 
 
 
231 aa  53.9  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  40 
 
 
248 aa  53.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  42.37 
 
 
334 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  32.5 
 
 
121 aa  52.8  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  33.77 
 
 
220 aa  52.8  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  40.79 
 
 
447 aa  52.4  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  43.33 
 
 
115 aa  52.4  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  32.33 
 
 
231 aa  52.4  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  34.57 
 
 
270 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  34.57 
 
 
264 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  30 
 
 
243 aa  51.6  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  32.1 
 
 
269 aa  51.2  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  32.91 
 
 
228 aa  50.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  33.77 
 
 
223 aa  50.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  35.8 
 
 
275 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  38.75 
 
 
288 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  36.9 
 
 
277 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1840  TonB family protein  34.57 
 
 
138 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.259302 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  31.71 
 
 
276 aa  49.7  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  34.62 
 
 
267 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  38.27 
 
 
233 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  36.9 
 
 
273 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  34.94 
 
 
441 aa  49.7  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  35.8 
 
 
245 aa  49.3  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  35.37 
 
 
285 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0080  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.44 
 
 
459 aa  48.9  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.163875 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  28.04 
 
 
202 aa  49.3  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1093  TonB family protein  30.95 
 
 
134 aa  49.3  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  29.49 
 
 
258 aa  48.9  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  37.18 
 
 
221 aa  48.9  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  37.66 
 
 
252 aa  48.5  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  30.49 
 
 
270 aa  48.5  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  29.76 
 
 
259 aa  48.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  29.63 
 
 
368 aa  48.1  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  25.69 
 
 
206 aa  48.1  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  33.75 
 
 
443 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  34.04 
 
 
273 aa  48.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  34.09 
 
 
225 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  37.35 
 
 
274 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  32.05 
 
 
275 aa  47.4  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  33.33 
 
 
467 aa  47.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  34.52 
 
 
259 aa  47.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  27.37 
 
 
204 aa  47.4  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  34.04 
 
 
266 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  34.04 
 
 
266 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  28.21 
 
 
403 aa  47.4  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  37.35 
 
 
275 aa  47.8  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  31.25 
 
 
206 aa  47.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  35.96 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  26.92 
 
 
367 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  34.07 
 
 
289 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  30.53 
 
 
131 aa  46.6  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  33.33 
 
 
332 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  27.52 
 
 
219 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  37.35 
 
 
286 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2174  TonB protein  29.87 
 
 
137 aa  46.6  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>