174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6395 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6395  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 222 aa  456  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5054  transcriptional regulator, TetR family  66.06 
 
 		 230 aa  329  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.699739 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2659  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144734  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3458  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3965  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 201 aa  97.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.396199  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0885  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126652 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1999  TetR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.897874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2933  transcriptional regulator, TetR family  24.49 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1711  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.418522  normal  0.678609 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1515  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 125 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1083  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  40 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  41.27 
 
 		 196 aa  49.3  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4577  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.957651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 271 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  33.87 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6452  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 217 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2401  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853887 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 218 aa  45.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2081  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 193 aa  45.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.586313 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2217  transcriptional regulator, TetR family  30.47 
 
 		 199 aa  45.8  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1946  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 191 aa  45.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  hitchhiker  0.00972871 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  44.23 
 
 		 224 aa  45.4  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 225 aa  45.4  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0593  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 268 aa  45.4  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.65008  normal  0.136354 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0590  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 189 aa  45.4  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 247 aa  45.4  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 214 aa  45.4  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3527  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 227 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal  0.540257 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 197 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2247  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 227 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 237 aa  45.1  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 243 aa  45.1  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 403 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 332 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0116  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  38.1 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2450  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0232  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  26.13 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  43.1 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 191 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  45.28 
 
 		 221 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 414 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 423 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2226  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3809  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2470  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>