87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2607 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2607  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 158 aa  322  9e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 		 144 aa  70.5  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4123  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00388815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  33.05 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2388  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  40.91 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5196  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5060  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.391119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  32.79 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5333  transcriptional regulator, MarR family  23.88 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.828951 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  31.75 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3350  transcriptional regulator, MarR family  34.95 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0764351  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0875  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445474 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4000  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.869888 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4686  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000388035  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  24.35 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2118  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0356  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 193 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 169 aa  51.2  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3949  transcriptional regulatory protein  41.18 
 
 		 179 aa  50.4  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3957  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432771  normal  0.0893513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4190  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4639  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 187 aa  48.9  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3617  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 150 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  29.09 
 
 		 156 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  27.38 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2106  transcriptional regulator, MarR family  39.06 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0650489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  28.69 
 
 		 287 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  35 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2156  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 173 aa  44.7  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4218  transcriptional regulator, MarR family  25.96 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440858  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0346  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 171 aa  44.3  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.668512  normal  0.0212996 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3581  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 160 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1367  transcriptional regulator, MarR family  24.63 
 
 		 147 aa  44.3  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000123372  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  35.05 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  23.26 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2187  hypothetical protein  31.31 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0800441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1031  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0524  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 146 aa  42  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0172488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 139 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3588  homoprotocatechuate degradation transcriptional regulator HpaR  28.69 
 
 		 164 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  37.1 
 
 		 142 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  34.43 
 
 		 139 aa  42  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  26.75 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  37.1 
 
 		 142 aa  42  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 157 aa  42  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 173 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  35.9 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  38.03 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  36.25 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  27.35 
 
 		 164 aa  41.6  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 159 aa  41.6  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  25.48 
 
 		 153 aa  41.2  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 145 aa  41.2  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 187 aa  40.8  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 175 aa  40.8  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  35.19 
 
 		 138 aa  40.8  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 150 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4933  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 157 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  23.7 
 
 		 149 aa  40.4  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>