More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17560 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_17560  protein translocase subunit secF  100 
 
 		 371 aa  737    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1365  protein-export membrane protein SecF  64.67 
 
 		 366 aa  480  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1799  protein-export membrane protein SecF  69.38 
 
 		 360 aa  476  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.544061  normal  0.135983 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1997  protein-export membrane protein SecF  60.16 
 
 		 358 aa  430  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498449  normal  0.0822875 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1671  protein-export membrane protein SecF  56.44 
 
 		 363 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2028  preprotein translocase subunit SecF  52.35 
 
 		 338 aa  365  1e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000424362 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13990  protein translocase subunit secF  52.66 
 
 		 364 aa  362  4e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269244  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2298  preprotein translocase subunit SecF  54.01 
 
 		 340 aa  360  2e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3050  protein-export membrane protein SecF  60.57 
 
 		 330 aa  352  5.9999999999999994e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15300  protein translocase subunit secF  54.6 
 
 		 406 aa  331  1e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1340  preprotein translocase subunit SecF  53.37 
 
 		 414 aa  328  8e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.265736  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2390  protein translocase subunit secF  51.67 
 
 		 412 aa  318  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12850  protein translocase subunit secF  53.53 
 
 		 346 aa  314  9.999999999999999e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0129827  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3390  protein-export membrane protein SecF  46.32 
 
 		 432 aa  290  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000120226  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2357  protein-export membrane protein SecF  51.28 
 
 		 389 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6108  preprotein translocase subunit SecF  48.2 
 
 		 347 aa  280  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2060  protein-export membrane protein SecF  54.05 
 
 		 326 aa  280  3e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5141  preprotein translocase subunit SecF  50.65 
 
 		 417 aa  279  6e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358124  hitchhiker  0.00205157 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15110  protein translocase subunit secF  47.71 
 
 		 414 aa  279  6e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3815  preprotein translocase subunit SecF  47.01 
 
 		 422 aa  278  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130348  normal  0.401094 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2584  preprotein translocase subunit SecF  44.15 
 
 		 423 aa  278  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173731  normal  0.904597 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2114  protein-export membrane protein SecF  47.06 
 
 		 390 aa  277  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205616  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3173  protein-export membrane protein SecF  51.16 
 
 		 453 aa  276  4e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12818  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1803  protein-export membrane protein SecF  43.77 
 
 		 394 aa  271  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162985  decreased coverage  0.00000393416 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1813  protein-export membrane protein SecF  45.29 
 
 		 394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.126223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3823  protein-export membrane protein SecF  47.4 
 
 		 416 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344735  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1374  preprotein translocase subunit SecF  50.33 
 
 		 398 aa  268  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2305  protein-export membrane protein SecF  44.47 
 
 		 421 aa  267  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.879944  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2316  preprotein translocase subunit SecF  45.23 
 
 		 417 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.658853  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2277  preprotein translocase subunit SecF  45.23 
 
 		 417 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2324  preprotein translocase subunit SecF  45.23 
 
 		 417 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223224  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1943  protein-export membrane protein SecF  44.92 
 
 		 374 aa  262  8e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00503357  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12606  preprotein translocase subunit SecF  41.22 
 
 		 442 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1696  protein-export membrane protein SecF  41.57 
 
 		 396 aa  251  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467956  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0946  protein-export membrane protein SecF  40.18 
 
 		 349 aa  227  2e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  36.07 
 
 		 977 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  36.01 
 
 		 900 aa  181  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  35.54 
 
 		 286 aa  176  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  38.26 
 
 		 855 aa  176  5e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  32.47 
 
 		 989 aa  173  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  32.67 
 
 		 303 aa  159  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  29.97 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  33.03 
 
 		 761 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1454  protein-export membrane protein SecF  36.52 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0298464  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  32.82 
 
 		 740 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  32.17 
 
 		 759 aa  144  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0903  protein translocase subunit secF  32.08 
 
 		 318 aa  142  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000021842  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  33.01 
 
 		 308 aa  142  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  31.4 
 
 		 735 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.64 
 
 		 991 aa  142  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  31 
 
 		 289 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  31 
 
 		 289 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  34.59 
 
 		 293 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  33.44 
 
 		 296 aa  139  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  31.99 
 
 		 291 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1335  protein translocase subunit secF  33.57 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  31.03 
 
 		 321 aa  137  4e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  32.41 
 
 		 307 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  34.15 
 
 		 307 aa  136  7.000000000000001e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.33 
 
 		 911 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  31.14 
 
 		 322 aa  133  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0066  protein-export membrane protein SecF  31.13 
 
 		 293 aa  133  6e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  31.89 
 
 		 315 aa  133  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  30.58 
 
 		 310 aa  132  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  30.56 
 
 		 292 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  32.76 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0027  preprotein translocase subunit SecF  32.89 
 
 		 310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  29.18 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  29.97 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  32.06 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  30.7 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  31 
 
 		 304 aa  130  5.0000000000000004e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.03 
 
 		 750 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  31 
 
 		 304 aa  130  5.0000000000000004e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.58 
 
 		 762 aa  129  7.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  29.63 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  31.38 
 
 		 323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  31.38 
 
 		 323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  31.38 
 
 		 323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  31.38 
 
 		 323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  31.02 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  31.38 
 
 		 323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1904  protein-export membrane protein SecF  28.62 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2443  preprotein translocase subunit SecF  29.59 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105757  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0537  protein-export membrane protein SecF  28.66 
 
 		 327 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000416815  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  28.89 
 
 		 1029 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  33.08 
 
 		 291 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0013  preprotein translocase subunit SecF  35.06 
 
 		 309 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245212 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  33.9 
 
 		 311 aa  126  5e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_002936  DET0332  preprotein translocase subunit SecF  31.74 
 
 		 301 aa  126  7e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.496269  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  29.32 
 
 		 310 aa  126  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  31.19 
 
 		 328 aa  125  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.6 
 
 		 763 aa  125  9e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1762  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.48 
 
 		 981 aa  125  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  32.8 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.62 
 
 		 759 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.62 
 
 		 759 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  29.71 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  30.87 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0312  preprotein translocase subunit SecF  30.72 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.111019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>