104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_00620 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  351  2.9999999999999997e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0154  membrane-flanked domain protein  50.86 
 
 		 178 aa  167  9e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  47.02 
 
 		 166 aa  121  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  40 
 
 		 185 aa  107  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  41.98 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  43.04 
 
 		 172 aa  104  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  43.04 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  43.04 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  38.89 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  39.47 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  38.32 
 
 		 203 aa  101  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  37.2 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  29.11 
 
 		 166 aa  98.6  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0795  membrane-flanked domain-containing protein  36.69 
 
 		 175 aa  97.1  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  35.36 
 
 		 189 aa  96.7  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  35.84 
 
 		 174 aa  93.2  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0703  hypothetical protein  36.97 
 
 		 167 aa  93.2  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  36.2 
 
 		 181 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  39.82 
 
 		 172 aa  88.2  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  32.73 
 
 		 172 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  35.9 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  29.56 
 
 		 479 aa  78.2  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  37.16 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  32.7 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0597  membrane-flanked domain-containing protein  34.59 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0610  membrane-flanked domain-containing protein  34.59 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0588  membrane-flanked domain-containing protein  34.59 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4362  membrane-flanked domain protein  40 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  32.61 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  28.29 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  27.22 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1328  membrane-flanked domain protein  27.22 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000392278 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  29.37 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1656  membrane-flanked domain-containing protein  29.3 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125781  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2015  hypothetical protein  35.33 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279675 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1284  membrane-flanked domain-containing protein  26.53 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.935757  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  31.15 
 
 		 247 aa  57  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  24.44 
 
 		 227 aa  57  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  26.22 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  31.87 
 
 		 522 aa  56.2  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  31.52 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  33.73 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  36.45 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  33.73 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2820  membrane-flanked domain-containing protein  33.06 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  29 
 
 		 283 aa  52.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  29.11 
 
 		 170 aa  51.6  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  28 
 
 		 291 aa  51.2  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  29.06 
 
 		 541 aa  50.8  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  34.69 
 
 		 232 aa  50.4  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  28.09 
 
 		 252 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  25 
 
 		 255 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  36.79 
 
 		 643 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3728  membrane-flanked domain protein  28.91 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.557347  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  27.78 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  25.32 
 
 		 229 aa  49.3  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2894  membrane-flanked domain protein  26.03 
 
 		 193 aa  48.1  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.622086 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  41.94 
 
 		 175 aa  48.1  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  41.94 
 
 		 180 aa  48.1  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  29.76 
 
 		 169 aa  47.8  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2080  membrane-flanked domain protein  29.06 
 
 		 170 aa  47.8  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222233  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  26.37 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2360  membrane-flanked domain protein  28.85 
 
 		 282 aa  47.4  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0847  hypothetical protein  27.81 
 
 		 371 aa  47  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1361  membrane-flanked domain  30.08 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.30148  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  26.45 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3581  membrane-flanked domain protein  27.1 
 
 		 166 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111681  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  23.62 
 
 		 169 aa  45.4  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0781  membrane-flanked domain-containing protein  34.44 
 
 		 180 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1403  hypothetical protein  27.91 
 
 		 165 aa  45.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1800  hypothetical protein  30.99 
 
 		 170 aa  45.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.504578  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1949  hypothetical protein  28.92 
 
 		 172 aa  45.1  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  29.31 
 
 		 153 aa  45.1  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3311  membrane-flanked domain protein  31.91 
 
 		 164 aa  45.1  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0274064 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3631  membrane-flanked domain-containing protein  34.38 
 
 		 179 aa  44.7  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0110103  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  28.37 
 
 		 245 aa  44.7  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 		 575 aa  44.3  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3185  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269357 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0679  membrane-flanked domain-containing protein  34.38 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000277417  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  30.95 
 
 		 513 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  34.38 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0623  membrane-flanked domain-containing protein  28.37 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.959285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3563  membrane-flanked domain protein  34.38 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0439159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1149  membrane-flanked domain protein  40.38 
 
 		 126 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  31.25 
 
 		 550 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0753  membrane-flanked domain-containing protein  32.22 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0485052 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0787  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  30.68 
 
 		 514 aa  43.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  30.91 
 
 		 501 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  30.66 
 
 		 161 aa  43.5  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14490  hypothetical protein  35.16 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  31.2 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2654  hypothetical protein  31.97 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2524  hypothetical protein  31.97 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  38.71 
 
 		 554 aa  42.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1464  membrane-flanked domain protein  32.91 
 
 		 506 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.454941  normal  0.217907 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  28.24 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0225  membrane-flanked domain protein  29.07 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  27.97 
 
 		 480 aa  42  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0149  membrane-flanked domain-containing protein  32.61 
 
 		 483 aa  42  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.808392  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>