54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8563 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  504  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  35.48 
 
 		 174 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  38.06 
 
 		 170 aa  99.4  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  33.52 
 
 		 179 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  36.14 
 
 		 179 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  37.04 
 
 		 176 aa  96.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  39.35 
 
 		 169 aa  96.3  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0847  hypothetical protein  30.57 
 
 		 371 aa  90.5  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  35.06 
 
 		 245 aa  88.6  8e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  34.84 
 
 		 176 aa  87  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  33.54 
 
 		 186 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2360  membrane-flanked domain protein  29.75 
 
 		 282 aa  82  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  33.54 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  32.3 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  32.91 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  27.71 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  33.91 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  30.72 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  26.88 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  28.14 
 
 		 243 aa  72  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1800  hypothetical protein  31.25 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.504578  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  27.39 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  29.25 
 
 		 170 aa  62  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  28.39 
 
 		 166 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  26.71 
 
 		 479 aa  59.3  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  33.08 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  28.12 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  28.42 
 
 		 203 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  26.09 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1361  membrane-flanked domain  31.06 
 
 		 172 aa  52  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.30148  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0703  hypothetical protein  26.67 
 
 		 167 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  27.27 
 
 		 170 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  27.45 
 
 		 169 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0154  membrane-flanked domain protein  27.73 
 
 		 178 aa  48.9  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  26.52 
 
 		 189 aa  46.6  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1403  hypothetical protein  30.72 
 
 		 165 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0473  membrane-flanked domain-containing protein  29.45 
 
 		 155 aa  46.2  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.325345  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  22.83 
 
 		 229 aa  46.2  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  30.77 
 
 		 189 aa  45.8  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  30.1 
 
 		 179 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7601  hypothetical protein  29.66 
 
 		 155 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  25.86 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  22.31 
 
 		 172 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  28.06 
 
 		 182 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  28.38 
 
 		 173 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  22.31 
 
 		 172 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2589  hypothetical protein  31.01 
 
 		 332 aa  43.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  28.24 
 
 		 174 aa  42.7  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  25.32 
 
 		 181 aa  42.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  31.25 
 
 		 172 aa  42.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  24.05 
 
 		 172 aa  42.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  30.26 
 
 		 153 aa  42.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  22.88 
 
 		 172 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0078  hypothetical protein  28.79 
 
 		 158 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0745922 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>