78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1843 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  100 
 
 		 185 aa  370  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  56.14 
 
 		 172 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  56.14 
 
 		 172 aa  205  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  56.14 
 
 		 172 aa  205  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  54.39 
 
 		 172 aa  187  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  52.63 
 
 		 181 aa  186  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  50.88 
 
 		 172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  51.74 
 
 		 170 aa  179  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  49.4 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  42.86 
 
 		 182 aa  145  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  40.57 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0795  membrane-flanked domain-containing protein  40.44 
 
 		 175 aa  107  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  42.48 
 
 		 180 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 		 189 aa  96.7  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  34.3 
 
 		 166 aa  92  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  30.18 
 
 		 174 aa  90.5  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  31.89 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0154  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 		 178 aa  89.4  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  31.44 
 
 		 479 aa  89.4  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0703  hypothetical protein  35.5 
 
 		 167 aa  87.8  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  45.79 
 
 		 179 aa  87.4  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  31.01 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  32.91 
 
 		 291 aa  81.3  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  44.44 
 
 		 166 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  32.28 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4362  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  32.35 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1284  membrane-flanked domain-containing protein  24.71 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.935757  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1328  membrane-flanked domain protein  23.43 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000392278 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  27.33 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  27.33 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  33.58 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  24.55 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  25.95 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1403  hypothetical protein  27.45 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0847  hypothetical protein  27.54 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  28.1 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  25.32 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  27.41 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  26.58 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  34.83 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  27.97 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  30.82 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  27.7 
 
 		 245 aa  54.7  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2360  membrane-flanked domain protein  28.25 
 
 		 282 aa  54.7  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1656  membrane-flanked domain-containing protein  40.54 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125781  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  26.09 
 
 		 252 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3728  membrane-flanked domain protein  24.65 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.557347  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  29.14 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  24.44 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1471  hypothetical protein  25.97 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  26.67 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1361  membrane-flanked domain  24.2 
 
 		 172 aa  52  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.30148  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  23.19 
 
 		 186 aa  51.6  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  30.54 
 
 		 169 aa  51.2  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  27.21 
 
 		 243 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2654  hypothetical protein  38.98 
 
 		 146 aa  49.3  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2524  hypothetical protein  38.98 
 
 		 146 aa  49.3  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  28.87 
 
 		 247 aa  49.3  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  26.75 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3581  membrane-flanked domain protein  28.36 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111681  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  30.92 
 
 		 561 aa  46.2  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2094  hypothetical protein  26.85 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.859623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  30.84 
 
 		 507 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0078  hypothetical protein  25.69 
 
 		 158 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0589  membrane-flanked domain-containing protein  26.22 
 
 		 486 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0611  membrane-flanked domain-containing protein  26.22 
 
 		 486 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  25.23 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7601  hypothetical protein  22.88 
 
 		 155 aa  42.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0149  membrane-flanked domain-containing protein  27.69 
 
 		 483 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.808392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0755  membrane-flanked domain-containing protein  28.12 
 
 		 480 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1149  membrane-flanked domain protein  33.96 
 
 		 126 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04064  membrane flanked domain family  27.35 
 
 		 180 aa  42  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0598  membrane-flanked domain-containing protein  26.28 
 
 		 474 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0824  hypothetical protein  30.86 
 
 		 167 aa  42  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.332875 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2927  membrane-flanked domain protein  23.16 
 
 		 190 aa  41.6  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0162  hypothetical protein  24.51 
 
 		 127 aa  41.6  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.373951  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  23.33 
 
 		 173 aa  40.8  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>