37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1800 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1800  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  339  9e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.504578  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  36.11 
 
 		 245 aa  84.3  8e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  35.33 
 
 		 243 aa  81.6  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  36.08 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2360  membrane-flanked domain protein  34.46 
 
 		 282 aa  78.2  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  31.1 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  34.07 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  33.77 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  33.11 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0847  hypothetical protein  34.46 
 
 		 371 aa  72  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  31.79 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  37.18 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  32.65 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  29.25 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  39.47 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  31.25 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  39.74 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  29.03 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  27.33 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  29.55 
 
 		 169 aa  48.1  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  29 
 
 		 219 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  28.46 
 
 		 181 aa  44.3  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  35.44 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  27.87 
 
 		 227 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  25.17 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  30.36 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  30.47 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  31.75 
 
 		 229 aa  42.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  35.8 
 
 		 172 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1656  membrane-flanked domain-containing protein  28.24 
 
 		 229 aa  41.6  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125781  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  30.39 
 
 		 172 aa  41.2  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  36.36 
 
 		 172 aa  41.2  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  36.36 
 
 		 172 aa  41.2  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  34.85 
 
 		 172 aa  40.8  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  24.32 
 
 		 575 aa  40.8  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>