43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1511 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  342  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  44.71 
 
 		 179 aa  164  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  45.56 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  32.1 
 
 		 176 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  39.41 
 
 		 245 aa  100  7e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  37.34 
 
 		 247 aa  100  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  31.14 
 
 		 255 aa  94.4  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  28.4 
 
 		 186 aa  88.2  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  36.31 
 
 		 170 aa  87.4  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  30.06 
 
 		 186 aa  87.4  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  30.77 
 
 		 174 aa  86.3  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  33.73 
 
 		 283 aa  85.1  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  32.12 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  34.16 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0847  hypothetical protein  32.69 
 
 		 371 aa  80.9  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  33.12 
 
 		 176 aa  80.5  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2360  membrane-flanked domain protein  30.13 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  35.67 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  26.88 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  30.63 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  29.11 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  30.81 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1800  hypothetical protein  27.33 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.504578  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  34.48 
 
 		 173 aa  51.6  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  26.29 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  25.71 
 
 		 172 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  25.71 
 
 		 172 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  24.49 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  28.28 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  27.91 
 
 		 189 aa  45.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  35.9 
 
 		 180 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4362  membrane-flanked domain protein  30.32 
 
 		 209 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1403  hypothetical protein  24.81 
 
 		 165 aa  44.3  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  25.62 
 
 		 232 aa  44.3  0.0009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  28.06 
 
 		 146 aa  44.3  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  31.03 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  26.19 
 
 		 219 aa  42.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1328  membrane-flanked domain protein  28.04 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000392278 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1361  membrane-flanked domain  23.64 
 
 		 172 aa  42  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.30148  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  29.22 
 
 		 182 aa  42  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  26.55 
 
 		 166 aa  41.6  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  27.4 
 
 		 181 aa  41.6  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  25.14 
 
 		 181 aa  41.6  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>