148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3015 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 		 575 aa  1126    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  31.78 
 
 		 494 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  28.18 
 
 		 486 aa  110  6e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  26.03 
 
 		 480 aa  109  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  25.4 
 
 		 493 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  23.49 
 
 		 472 aa  103  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  27.65 
 
 		 632 aa  102  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  28.54 
 
 		 561 aa  97.8  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  24.52 
 
 		 504 aa  95.9  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  26.94 
 
 		 547 aa  95.9  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  24.04 
 
 		 467 aa  92.8  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  19.88 
 
 		 479 aa  91.3  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  23.27 
 
 		 472 aa  89  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  25.56 
 
 		 501 aa  89.4  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  21.86 
 
 		 472 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  23.87 
 
 		 514 aa  87.8  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  26.61 
 
 		 512 aa  87.8  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  21.32 
 
 		 480 aa  87.4  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  23.5 
 
 		 472 aa  87  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  25.6 
 
 		 521 aa  86.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  24.5 
 
 		 472 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  24.5 
 
 		 472 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  21.38 
 
 		 471 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  20.29 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  23.9 
 
 		 472 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  26.89 
 
 		 549 aa  81.6  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3047  serine/threonine protein kinase  22.31 
 
 		 504 aa  79.7  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  21.94 
 
 		 472 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  29.89 
 
 		 498 aa  78.6  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  19.91 
 
 		 453 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  20.83 
 
 		 486 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  26.33 
 
 		 449 aa  77  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  21.26 
 
 		 486 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  19.19 
 
 		 470 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  24.88 
 
 		 491 aa  74.7  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  20.99 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  24.75 
 
 		 575 aa  73.9  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  26.61 
 
 		 634 aa  72.4  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  23.4 
 
 		 513 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  26.09 
 
 		 542 aa  72  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  31.61 
 
 		 530 aa  72  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  23.03 
 
 		 492 aa  72  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  25.07 
 
 		 551 aa  71.6  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  25.85 
 
 		 609 aa  71.6  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1331  membrane-flanked domain protein  26.55 
 
 		 511 aa  71.2  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.280277  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0224  membrane-flanked domain protein  26.44 
 
 		 488 aa  71.2  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  25.47 
 
 		 554 aa  70.1  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  23.47 
 
 		 522 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  24.48 
 
 		 476 aa  70.1  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  24.95 
 
 		 489 aa  69.3  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  32.08 
 
 		 555 aa  69.3  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  21.14 
 
 		 541 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1083  membrane protein-like protein  24.58 
 
 		 515 aa  68.2  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.76486  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  20.25 
 
 		 476 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  19.66 
 
 		 474 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  24.32 
 
 		 483 aa  66.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  42.17 
 
 		 579 aa  65.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  25.75 
 
 		 646 aa  65.1  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  25.44 
 
 		 643 aa  64.3  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  23 
 
 		 558 aa  62.8  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0732  membrane-flanked domain-containing protein  19.88 
 
 		 506 aa  62  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.924823  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  30.25 
 
 		 507 aa  61.6  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  32.75 
 
 		 555 aa  59.3  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  24.83 
 
 		 504 aa  58.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  25.1 
 
 		 554 aa  58.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  25.08 
 
 		 550 aa  58.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  26.1 
 
 		 491 aa  57.8  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1464  membrane-flanked domain protein  23.49 
 
 		 506 aa  56.6  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.454941  normal  0.217907 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2002  hypothetical protein  19.89 
 
 		 483 aa  56.2  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2110  membrane-flanked domain-containing protein  20.71 
 
 		 527 aa  57  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.961719  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2148  membrane-flanked domain-containing protein  20.71 
 
 		 527 aa  57  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.290456  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1063  membrane-flanked domain protein  25.32 
 
 		 516 aa  56.6  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6784  membrane protein-like protein  23.49 
 
 		 508 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  27.17 
 
 		 469 aa  55.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  26.17 
 
 		 169 aa  54.7  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1151  membrane-flanked domain-containing protein  26.64 
 
 		 533 aa  53.9  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0589  membrane-flanked domain-containing protein  24.64 
 
 		 486 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  23.23 
 
 		 443 aa  53.9  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  32.69 
 
 		 161 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3800  membrane-flanked domain protein  23.94 
 
 		 501 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.149133  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1686  hypothetical protein  17.24 
 
 		 501 aa  51.2  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0755  membrane-flanked domain-containing protein  24.47 
 
 		 480 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  29.93 
 
 		 177 aa  50.8  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  33.07 
 
 		 190 aa  50.8  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2116  membrane-flanked domain protein  31.11 
 
 		 155 aa  50.4  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0611  membrane-flanked domain-containing protein  24.43 
 
 		 486 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2525  membrane-flanked domain protein  34.07 
 
 		 160 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  28.67 
 
 		 658 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1686  membrane-flanked domain protein  25.81 
 
 		 532 aa  50.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00477785  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  35.16 
 
 		 159 aa  48.9  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  29.55 
 
 		 165 aa  49.3  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  32.5 
 
 		 162 aa  48.9  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1783  membrane-flanked domain protein  29.25 
 
 		 192 aa  49.3  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  28.45 
 
 		 174 aa  48.9  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  28.23 
 
 		 163 aa  48.9  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2081  membrane-flanked domain protein  30.89 
 
 		 540 aa  48.5  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0739887  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2821  membrane-flanked domain-containing protein  31.05 
 
 		 527 aa  47.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3185  membrane-flanked domain-containing protein  28.71 
 
 		 180 aa  48.1  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269357 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5070  membrane-flanked domain-containing protein  29.81 
 
 		 169 aa  47.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  34.21 
 
 		 232 aa  47.8  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>