37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0847 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0847  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  723    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2360  membrane-flanked domain protein  64.1 
 
 
282 aa  199  9e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  44.97 
 
 
245 aa  152  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  44.64 
 
 
176 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  44.05 
 
 
176 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  42.86 
 
 
247 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  42.95 
 
 
174 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  46.1 
 
 
170 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  42.38 
 
 
186 aa  116  7.999999999999999e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  43.95 
 
 
169 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  36.65 
 
 
283 aa  109  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  37.09 
 
 
186 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  37.27 
 
 
291 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  32.18 
 
 
255 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  37.72 
 
 
179 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  38.1 
 
 
179 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  37.79 
 
 
243 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  36.2 
 
 
172 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  30.57 
 
 
252 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  32.69 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1800  hypothetical protein  34.46 
 
 
170 aa  70.9  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.504578  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  27.54 
 
 
185 aa  56.6  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  31.21 
 
 
174 aa  54.3  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  24.49 
 
 
479 aa  54.7  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  30 
 
 
170 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  26.54 
 
 
180 aa  49.7  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  27.54 
 
 
172 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  24.82 
 
 
166 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  30.83 
 
 
181 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  25.3 
 
 
166 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  26.63 
 
 
189 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  28.79 
 
 
181 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  29.46 
 
 
179 aa  44.3  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  27.03 
 
 
227 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  27.69 
 
 
172 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  27.69 
 
 
172 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  27.69 
 
 
172 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>