64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3541 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  357  4e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  72.73 
 
 		 176 aa  273  9e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  63.07 
 
 		 174 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  60.82 
 
 		 170 aa  192  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  57.89 
 
 		 169 aa  184  8e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  45.56 
 
 		 172 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0847  hypothetical protein  44.05 
 
 		 371 aa  141  5e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  42.51 
 
 		 179 aa  137  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  43.11 
 
 		 179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2360  membrane-flanked domain protein  44.52 
 
 		 282 aa  134  7.000000000000001e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  39.64 
 
 		 247 aa  129  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  43.14 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  41.98 
 
 		 186 aa  125  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  43.21 
 
 		 291 aa  124  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  43.21 
 
 		 283 aa  123  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  40.24 
 
 		 245 aa  121  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  37.72 
 
 		 186 aa  118  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  41.18 
 
 		 243 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  33.12 
 
 		 170 aa  95.5  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  34.19 
 
 		 252 aa  93.6  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1800  hypothetical protein  35.22 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.504578  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  30.28 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  37.35 
 
 		 180 aa  60.8  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  27.74 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  29.77 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  27.74 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  34.62 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  32.67 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  33 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  27.34 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  30.68 
 
 		 479 aa  55.1  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  31.87 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  32.91 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  26.98 
 
 		 232 aa  53.9  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  25.56 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  34.48 
 
 		 181 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  29.88 
 
 		 170 aa  51.6  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  31.25 
 
 		 189 aa  50.8  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  27.83 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  34.38 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4362  membrane-flanked domain protein  27.27 
 
 		 209 aa  48.5  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  26.62 
 
 		 203 aa  48.9  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  27.78 
 
 		 173 aa  48.1  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1669  hypothetical protein  28.08 
 
 		 574 aa  47  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  23.73 
 
 		 227 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  30.16 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  35.29 
 
 		 483 aa  45.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  26.72 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  34.25 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  28.57 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2654  hypothetical protein  24.14 
 
 		 146 aa  45.1  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2524  hypothetical protein  24.14 
 
 		 146 aa  45.1  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2927  membrane-flanked domain protein  29.17 
 
 		 190 aa  44.7  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1471  hypothetical protein  25.18 
 
 		 155 aa  44.3  0.0009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  26.79 
 
 		 229 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1656  membrane-flanked domain-containing protein  22.22 
 
 		 229 aa  43.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125781  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  23.02 
 
 		 182 aa  41.6  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0787  membrane-flanked domain-containing protein  30.67 
 
 		 176 aa  41.2  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  30.67 
 
 		 179 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3185  membrane-flanked domain-containing protein  30.67 
 
 		 180 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269357 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3563  membrane-flanked domain protein  30.67 
 
 		 179 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0439159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0781  membrane-flanked domain-containing protein  30.67 
 
 		 180 aa  41.2  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0679  membrane-flanked domain-containing protein  30.67 
 
 		 179 aa  40.8  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000277417  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3631  membrane-flanked domain-containing protein  30.67 
 
 		 179 aa  40.8  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0110103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>