50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4260 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  100 
 
 		 243 aa  481  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  41.42 
 
 		 176 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  38.76 
 
 		 179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  35.53 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  36.75 
 
 		 186 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  38.57 
 
 		 283 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  39.88 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  41.03 
 
 		 169 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  40.96 
 
 		 176 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  37.97 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2360  membrane-flanked domain protein  36.9 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  34.88 
 
 		 186 aa  106  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  38.57 
 
 		 291 aa  106  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0847  hypothetical protein  37.71 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  36.81 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  38.75 
 
 		 170 aa  102  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  38.04 
 
 		 172 aa  97.1  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  34.97 
 
 		 247 aa  92.8  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1800  hypothetical protein  35.33 
 
 		 170 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.504578  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  28.14 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  29.94 
 
 		 170 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  37.74 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  24.84 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  29.41 
 
 		 170 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  27.07 
 
 		 166 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  23.58 
 
 		 479 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  28.65 
 
 		 180 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  26.45 
 
 		 169 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  30.87 
 
 		 172 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  30.87 
 
 		 172 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  29.45 
 
 		 172 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  32.79 
 
 		 172 aa  52  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  33.94 
 
 		 172 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  26.53 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  33.03 
 
 		 181 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  29.05 
 
 		 174 aa  50.1  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  27.89 
 
 		 185 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  29.11 
 
 		 189 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  29.41 
 
 		 189 aa  48.5  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  28.74 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  28.12 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0515  membrane-flanked domain protein  27.78 
 
 		 183 aa  45.4  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.666487  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2654  hypothetical protein  26.67 
 
 		 146 aa  45.4  0.0009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2524  hypothetical protein  26.67 
 
 		 146 aa  45.4  0.0009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4362  membrane-flanked domain protein  35.09 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1783  membrane-flanked domain protein  26.59 
 
 		 192 aa  43.9  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  28.57 
 
 		 166 aa  43.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1471  hypothetical protein  26.83 
 
 		 155 aa  42  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1361  membrane-flanked domain  27.86 
 
 		 172 aa  42  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.30148  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2018  hypothetical protein  31.5 
 
 		 196 aa  41.6  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.522733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>