67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3493 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 		 166 aa  336  8e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  41.57 
 
 		 180 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  47.02 
 
 		 179 aa  115  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  38.51 
 
 		 203 aa  106  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0154  membrane-flanked domain protein  37.42 
 
 		 178 aa  103  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0795  membrane-flanked domain-containing protein  33.92 
 
 		 175 aa  97.1  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  35 
 
 		 170 aa  95.5  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  37.65 
 
 		 185 aa  95.5  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  34.04 
 
 		 174 aa  93.6  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  31.36 
 
 		 166 aa  92  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  35 
 
 		 189 aa  90.5  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  34.73 
 
 		 181 aa  90.5  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  35.43 
 
 		 172 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  35.43 
 
 		 172 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  36.59 
 
 		 172 aa  89  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  33.75 
 
 		 189 aa  85.5  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  35.53 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  34.57 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  34.48 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  28.83 
 
 		 479 aa  73.6  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0703  hypothetical protein  30 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  30.92 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  29.38 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1284  membrane-flanked domain-containing protein  28.74 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.935757  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  29.34 
 
 		 252 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  32.41 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  29.77 
 
 		 247 aa  54.7  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  27.67 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0847  hypothetical protein  25.9 
 
 		 371 aa  53.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  35.85 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4362  membrane-flanked domain protein  36 
 
 		 209 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  29.8 
 
 		 186 aa  51.6  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  30.37 
 
 		 245 aa  50.8  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  31.33 
 
 		 232 aa  50.4  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  31.51 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  26.32 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  27.66 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  25 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2360  membrane-flanked domain protein  24.39 
 
 		 282 aa  48.5  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  27.19 
 
 		 283 aa  48.1  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  27.19 
 
 		 291 aa  47.8  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  28.77 
 
 		 170 aa  47.4  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0753  membrane-flanked domain-containing protein  32.22 
 
 		 180 aa  47.4  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0485052 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  30.85 
 
 		 513 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0781  membrane-flanked domain-containing protein  31.11 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3185  membrane-flanked domain-containing protein  31.11 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269357 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  28.57 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1656  membrane-flanked domain-containing protein  28.03 
 
 		 229 aa  45.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125781  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  29.13 
 
 		 219 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  29.03 
 
 		 172 aa  45.1  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1800  hypothetical protein  31.39 
 
 		 170 aa  44.7  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.504578  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3631  membrane-flanked domain-containing protein  30 
 
 		 179 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0110103  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  28.57 
 
 		 255 aa  44.3  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  30 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0679  membrane-flanked domain-containing protein  28.89 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000277417  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3563  membrane-flanked domain protein  30 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0439159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0787  membrane-flanked domain-containing protein  28.89 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1328  membrane-flanked domain protein  27.59 
 
 		 198 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000392278 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  27.14 
 
 		 480 aa  42.4  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  23.28 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  22.86 
 
 		 170 aa  42  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3849  hypothetical protein  37.5 
 
 		 180 aa  41.2  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  24.04 
 
 		 229 aa  41.2  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  26.58 
 
 		 170 aa  40.8  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  30.85 
 
 		 514 aa  40.4  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2015  hypothetical protein  25.53 
 
 		 161 aa  40.4  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279675 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>