75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0858 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 		 189 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  78.31 
 
 		 189 aa  260  8e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  47.02 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0795  membrane-flanked domain-containing protein  43.11 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  38.29 
 
 		 170 aa  121  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  38.73 
 
 		 169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  40 
 
 		 172 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  39.38 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  39.38 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  34.71 
 
 		 166 aa  107  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  36.57 
 
 		 180 aa  107  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0703  hypothetical protein  41.98 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4362  membrane-flanked domain protein  44.24 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  34.05 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  37.65 
 
 		 181 aa  101  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  33.33 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  37.28 
 
 		 172 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  35.8 
 
 		 172 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  37.58 
 
 		 174 aa  96.7  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0154  membrane-flanked domain protein  33.87 
 
 		 178 aa  93.6  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  35.36 
 
 		 179 aa  85.5  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  36.36 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  37.89 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  25.73 
 
 		 479 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  32.12 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  31.79 
 
 		 283 aa  62  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  31.61 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  28.77 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  28.95 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  28.22 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  28.7 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  27.63 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  28.91 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1284  membrane-flanked domain-containing protein  32.14 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.935757  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0679  membrane-flanked domain-containing protein  30.71 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000277417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  26.36 
 
 		 252 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3631  membrane-flanked domain-containing protein  30.71 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0110103  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  28.68 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  30.3 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  30 
 
 		 243 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3563  membrane-flanked domain protein  30.71 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0439159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  30.71 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3185  membrane-flanked domain-containing protein  31.11 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269357 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0781  membrane-flanked domain-containing protein  31.11 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  22.22 
 
 		 227 aa  52.4  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  26.12 
 
 		 146 aa  52  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0753  membrane-flanked domain-containing protein  30 
 
 		 180 aa  51.6  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0485052 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3728  membrane-flanked domain protein  28.28 
 
 		 176 aa  51.2  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.557347  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  27.61 
 
 		 186 aa  51.2  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1361  membrane-flanked domain  25.19 
 
 		 172 aa  51.2  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.30148  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1403  hypothetical protein  24.44 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  26.14 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0787  membrane-flanked domain-containing protein  30.3 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  26.14 
 
 		 180 aa  50.4  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  34.38 
 
 		 174 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  28.15 
 
 		 153 aa  49.3  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0847  hypothetical protein  31.01 
 
 		 371 aa  48.9  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2360  membrane-flanked domain protein  28.23 
 
 		 282 aa  48.9  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  27.52 
 
 		 219 aa  48.5  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  33.85 
 
 		 172 aa  47.8  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0824  hypothetical protein  26.67 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.332875 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  28.7 
 
 		 247 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  36.21 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  28.32 
 
 		 486 aa  45.8  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  32.76 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  34.48 
 
 		 169 aa  45.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1328  membrane-flanked domain protein  26.92 
 
 		 198 aa  44.7  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000392278 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2015  hypothetical protein  28.97 
 
 		 161 aa  44.7  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279675 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  31.68 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3849  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1669  hypothetical protein  26.9 
 
 		 574 aa  42.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3047  serine/threonine protein kinase  24.77 
 
 		 504 aa  42.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1783  membrane-flanked domain protein  29.91 
 
 		 192 aa  41.2  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0948  membrane-flanked domain-containing protein  42.31 
 
 		 174 aa  41.2  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.405275 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>