80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0804 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 
189 aa  374  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  78.31 
 
 
189 aa  261  6e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  45.83 
 
 
181 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0795  membrane-flanked domain-containing protein  41.32 
 
 
175 aa  128  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311521  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  41.86 
 
 
169 aa  118  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  37.5 
 
 
170 aa  114  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4362  membrane-flanked domain protein  47.27 
 
 
209 aa  111  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  39.38 
 
 
172 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  34.5 
 
 
185 aa  106  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  38.75 
 
 
172 aa  104  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  34.64 
 
 
203 aa  104  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  38.75 
 
 
172 aa  104  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  38.89 
 
 
172 aa  103  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  37.65 
 
 
181 aa  102  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  36.42 
 
 
172 aa  102  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  32.95 
 
 
180 aa  100  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0154  membrane-flanked domain protein  38.15 
 
 
178 aa  99.4  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  31.33 
 
 
166 aa  98.2  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0703  hypothetical protein  38.12 
 
 
167 aa  96.3  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  38.89 
 
 
179 aa  91.3  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  37.82 
 
 
182 aa  90.1  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  32.35 
 
 
174 aa  86.7  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  35 
 
 
166 aa  84  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  23.98 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  24.55 
 
 
479 aa  65.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  30.3 
 
 
170 aa  61.6  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  28.17 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  25.7 
 
 
186 aa  55.5  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1284  membrane-flanked domain-containing protein  26.19 
 
 
208 aa  54.7  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.935757  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  32.71 
 
 
176 aa  54.3  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  29.87 
 
 
232 aa  53.9  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  32.45 
 
 
243 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  26.32 
 
 
179 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  26.98 
 
 
176 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  24.46 
 
 
252 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  29.84 
 
 
245 aa  52  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  29.8 
 
 
153 aa  51.6  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  25 
 
 
186 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  30.17 
 
 
291 aa  49.3  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  30.17 
 
 
283 aa  49.7  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  26.87 
 
 
146 aa  49.3  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  36.47 
 
 
555 aa  48.5  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  27.87 
 
 
176 aa  48.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  27.11 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  24.82 
 
 
175 aa  47.4  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3563  membrane-flanked domain protein  26.8 
 
 
179 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0439159  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0679  membrane-flanked domain-containing protein  27.85 
 
 
179 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000277417  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0787  membrane-flanked domain-containing protein  27.85 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3631  membrane-flanked domain-containing protein  26.8 
 
 
179 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0110103  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  24.26 
 
 
180 aa  47  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  26.8 
 
 
179 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  33.8 
 
 
512 aa  46.6  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  32 
 
 
480 aa  45.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0847  hypothetical protein  28.57 
 
 
371 aa  45.4  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  32.11 
 
 
658 aa  45.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  32.58 
 
 
247 aa  45.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3511  membrane-flanked domain-containing protein  35.19 
 
 
165 aa  44.7  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819135  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  27.73 
 
 
486 aa  44.7  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  27.78 
 
 
255 aa  44.7  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0781  membrane-flanked domain-containing protein  25.51 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1800  hypothetical protein  31.51 
 
 
170 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.504578  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2360  membrane-flanked domain protein  26.61 
 
 
282 aa  43.9  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0732  membrane-flanked domain-containing protein  18.92 
 
 
506 aa  43.9  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.924823  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1656  membrane-flanked domain-containing protein  29.03 
 
 
229 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125781  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1328  membrane-flanked domain protein  25.23 
 
 
198 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000392278 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1361  membrane-flanked domain  22.82 
 
 
172 aa  43.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.30148  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3185  membrane-flanked domain-containing protein  25.51 
 
 
180 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00269357 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  29.31 
 
 
174 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  31.52 
 
 
229 aa  42.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1403  hypothetical protein  26.09 
 
 
165 aa  42.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0836  membrane-flanked domain-containing protein  29.82 
 
 
179 aa  42.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.420646  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0753  membrane-flanked domain-containing protein  24.49 
 
 
180 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0485052 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0824  hypothetical protein  29.03 
 
 
167 aa  42  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.332875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1063  membrane-flanked domain protein  29.58 
 
 
516 aa  42  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0446  membrane-flanked domain  20.16 
 
 
194 aa  41.6  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000176229  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1471  hypothetical protein  23.7 
 
 
155 aa  41.6  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21830  hypothetical protein  29.59 
 
 
544 aa  41.2  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0642218  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  33.9 
 
 
173 aa  41.2  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  25 
 
 
493 aa  41.2  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  37.29 
 
 
575 aa  41.2  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>