58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06580 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  380  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  70.81 
 
 		 186 aa  281  5.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  44.17 
 
 		 179 aa  135  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  41.98 
 
 		 179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2360  membrane-flanked domain protein  41.06 
 
 		 282 aa  123  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  40.88 
 
 		 176 aa  121  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  39.29 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  42.68 
 
 		 170 aa  119  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0847  hypothetical protein  42.38 
 
 		 371 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  37.72 
 
 		 176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  37.22 
 
 		 247 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  38.61 
 
 		 169 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  38.41 
 
 		 245 aa  109  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  34.88 
 
 		 243 aa  107  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  35.67 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  38.1 
 
 		 283 aa  97.1  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  36.77 
 
 		 291 aa  94.7  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  35.95 
 
 		 255 aa  92  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  30.06 
 
 		 170 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  33.54 
 
 		 252 aa  84.7  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1800  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.504578  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  27.95 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  30.12 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  28.57 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  26.52 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  27.86 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  26.87 
 
 		 479 aa  56.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0703  hypothetical protein  28.57 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  25.77 
 
 		 172 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  25.77 
 
 		 172 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  27.1 
 
 		 170 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  30.26 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  25.77 
 
 		 172 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1656  membrane-flanked domain-containing protein  25.53 
 
 		 229 aa  52.4  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125781  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  32.53 
 
 		 180 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  23.19 
 
 		 185 aa  51.6  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  29.81 
 
 		 181 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  28.44 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  28.22 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1471  hypothetical protein  28.3 
 
 		 155 aa  50.4  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  25.97 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  34.38 
 
 		 166 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  28.97 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  25.17 
 
 		 203 aa  48.9  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1669  hypothetical protein  24.14 
 
 		 574 aa  48.5  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  27.63 
 
 		 227 aa  48.5  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  23.58 
 
 		 219 aa  48.5  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  28.97 
 
 		 180 aa  48.5  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  27.27 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  25.7 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  27.1 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0446  membrane-flanked domain  30.56 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000176229  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  27.78 
 
 		 541 aa  45.4  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  23.91 
 
 		 182 aa  44.7  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1361  membrane-flanked domain  22.14 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.30148  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0188  hypothetical protein  23.57 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.167897 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  22.73 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1403  hypothetical protein  23.53 
 
 		 165 aa  41.2  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>