63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0473 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  489  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  46.75 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2360  membrane-flanked domain protein  46.84 
 
 		 282 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  43.56 
 
 		 176 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  41.92 
 
 		 174 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0847  hypothetical protein  42.86 
 
 		 371 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  38.95 
 
 		 291 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  38.76 
 
 		 186 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  37.79 
 
 		 283 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  41.1 
 
 		 169 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  40.99 
 
 		 170 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  38.46 
 
 		 176 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  40.76 
 
 		 179 aa  111  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  35.96 
 
 		 255 aa  111  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  37.22 
 
 		 186 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  40.99 
 
 		 172 aa  108  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  38.46 
 
 		 179 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  37.34 
 
 		 170 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  35.2 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1800  hypothetical protein  32.28 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.504578  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  28.03 
 
 		 252 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  27.66 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2927  membrane-flanked domain protein  33.64 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  27.66 
 
 		 479 aa  56.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  23.49 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  27.94 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  28.21 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  28.21 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  28.21 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  30.3 
 
 		 170 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4362  membrane-flanked domain protein  35.42 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  31.43 
 
 		 179 aa  53.9  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  25 
 
 		 172 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  25.23 
 
 		 172 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  27.1 
 
 		 181 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  32.56 
 
 		 173 aa  53.1  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  27.98 
 
 		 174 aa  51.2  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  33.68 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  30.3 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1656  membrane-flanked domain-containing protein  26.77 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125781  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  24.11 
 
 		 175 aa  50.4  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  34.02 
 
 		 181 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  24.11 
 
 		 180 aa  49.7  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  29.41 
 
 		 203 aa  50.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0154  membrane-flanked domain protein  30.09 
 
 		 178 aa  48.9  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  26.8 
 
 		 185 aa  48.5  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  28.7 
 
 		 189 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  32.14 
 
 		 170 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  35.48 
 
 		 180 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  32.58 
 
 		 189 aa  46.6  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  27.45 
 
 		 146 aa  46.2  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  29.63 
 
 		 182 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  34.48 
 
 		 166 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0703  hypothetical protein  32 
 
 		 167 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2524  hypothetical protein  26.42 
 
 		 146 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0473  membrane-flanked domain-containing protein  32.47 
 
 		 155 aa  43.5  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.325345  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2654  hypothetical protein  26.42 
 
 		 146 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2926  membrane-flanked domain protein  27.27 
 
 		 231 aa  43.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3563  membrane-flanked domain protein  28.23 
 
 		 179 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0439159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  28.23 
 
 		 179 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3631  membrane-flanked domain-containing protein  28.23 
 
 		 179 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0110103  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1284  membrane-flanked domain-containing protein  28.57 
 
 		 208 aa  42  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.935757  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1361  membrane-flanked domain  25.93 
 
 		 172 aa  42  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.30148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>