73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1279 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  359  1e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  87.15 
 
 		 179 aa  324  5e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  45.56 
 
 		 170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  41.57 
 
 		 176 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  43.27 
 
 		 186 aa  138  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  44.17 
 
 		 186 aa  135  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  40.36 
 
 		 174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  44.59 
 
 		 169 aa  121  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  43.59 
 
 		 170 aa  120  9e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  41.4 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  43.95 
 
 		 176 aa  119  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2360  membrane-flanked domain protein  43.23 
 
 		 282 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  40 
 
 		 245 aa  116  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  39.49 
 
 		 291 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  36.54 
 
 		 255 aa  114  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  39.24 
 
 		 283 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  38.76 
 
 		 243 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  38.12 
 
 		 247 aa  108  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0847  hypothetical protein  37.72 
 
 		 371 aa  104  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  36.14 
 
 		 252 aa  97.8  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1800  hypothetical protein  33.77 
 
 		 170 aa  73.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.504578  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  28.74 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  28.9 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  27.68 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  28.03 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  27.12 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  27.12 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  27.41 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  26.22 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  32.5 
 
 		 219 aa  54.3  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  28.57 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  33.73 
 
 		 179 aa  51.6  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  33.07 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0188  hypothetical protein  25 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.167897 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  29.63 
 
 		 182 aa  49.3  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  29.22 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  28.57 
 
 		 166 aa  49.3  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  25.99 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  22.75 
 
 		 172 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  27.69 
 
 		 146 aa  48.9  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  24.06 
 
 		 172 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2524  hypothetical protein  24.83 
 
 		 146 aa  48.5  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2654  hypothetical protein  24.83 
 
 		 146 aa  48.5  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  26.92 
 
 		 181 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0781  membrane-flanked domain-containing protein  38.24 
 
 		 180 aa  47.8  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  28.17 
 
 		 229 aa  47  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  26.44 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1361  membrane-flanked domain  25.95 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.30148  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  30 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3185  membrane-flanked domain-containing protein  36.76 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269357 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  26.45 
 
 		 479 aa  45.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3849  hypothetical protein  39.34 
 
 		 180 aa  45.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0836  membrane-flanked domain-containing protein  38.89 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.420646  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  32.18 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0753  membrane-flanked domain-containing protein  35.29 
 
 		 180 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0485052 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  29.63 
 
 		 189 aa  45.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1403  hypothetical protein  24.63 
 
 		 165 aa  45.1  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1656  membrane-flanked domain-containing protein  28.17 
 
 		 229 aa  45.1  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125781  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0787  membrane-flanked domain-containing protein  40.74 
 
 		 176 aa  44.3  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  23.03 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7601  hypothetical protein  24.62 
 
 		 155 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3182  membrane-flanked domain-containing protein  38.89 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  40.74 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3563  membrane-flanked domain protein  40.74 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0439159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3631  membrane-flanked domain-containing protein  38.89 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0110103  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  28.81 
 
 		 227 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0679  membrane-flanked domain-containing protein  38.89 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000277417  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1669  hypothetical protein  23.24 
 
 		 574 aa  42  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  33.96 
 
 		 153 aa  41.6  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0703  hypothetical protein  31.16 
 
 		 167 aa  41.6  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0154  membrane-flanked domain protein  28.87 
 
 		 178 aa  41.2  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1783  membrane-flanked domain protein  29.63 
 
 		 192 aa  41.2  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2589  hypothetical protein  27.18 
 
 		 332 aa  41.2  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>